Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  341  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106598465--106598516
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1.9
27
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0
77
25
15
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48
1.78
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80
1.9
80
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2
183
22
30
24
22
1.99
106603488--106603595
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
106611568--106611716
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
106611609--106611716
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
106621057--106621091
18
2.0
18
94
5
63
17
31
40
11
1.85
106625731--106625795
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1.9
34
87
0
94
41
13
12
32
1.82
106625721--106625806
34
2.5
34
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163
23
25
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4.2
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0
175
33
5
23
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2.1
136
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0
525
24
18
25
31
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4.2
26
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1
175
33
5
23
36
1.78
106642315--106642599
135
2.1
137
96
1
520
24
18
25
31
1.97
106646360--106646468
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4.2
26
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1
175
33
5
23
36
1.78
106648246--106648531
136
2.1
137
96
0
520
24
18
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32
1.97
106652689--106652818
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3.3
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163
23
25
28
23
1.99
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17
1.9
17
100
0
66
39
24
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30
1.79
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5.0
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80
0
64
66
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24
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2.0
21
100
0
86
32
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18
39
1.83
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96
1.9
97
88
1
276
31
25
14
28
1.95
106663856--106663899
6
6.8
6
80
14
52
79
2
4
13
0.98
106670214--106670263
10
5.0
10
85
0
73
64
2
10
24
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106671224--106671260
9
4.1
9
92
0
65
45
13
10
29
1.77
106672196--106672222
5
5.4
5
100
0
54
22
18
18
40
1.91
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33
2.1
33
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0
131
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10
24
1.55
106676809--106676916
26
4.2
26
90
0
171
36
24
7
32
1.83
106677317--106677341
8
3.1
8
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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60
60
0
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30
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61
60
0
6
32
1.28
106677448--106677665
17
11.9
17
66
21
63
61
0
5
32
1.27
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205
2.5
206
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28
21
18
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1.97
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44
2.1
44
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4
114
25
26
17
31
1.97
106679909--106680002
44
2.1
45
80
5
102
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13
37
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0
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2.2
16
100
0
72
16
33
11
38
1.84
106691569--106691638
33
2.1
33
97
0
131
58
7
10
24
1.55
106692048--106692095
12
3.8
12
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20
53
60
2
6
31
1.33
106692204--106692265
22
2.8
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69
61
1
6
30
1.31
106692247--106692349
3
36.0
3
69
21
53
63
0
3
33
1.13
106692266--106692321
22
2.6
21
80
11
60
60
0
7
32
1.24
106692247--106692348
13
7.8
13
70
19
54
63
0
3
32
1.12
106692268--106692349
36
2.3
35
83
10
94
62
0
4
32
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2.1
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10
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50
2
5
41
1.42
106696937--106696968
3
10.7
3
100
0
64
68
0
0
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106703890--106704032
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3.3
43
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143
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17
24
30
1.97
106712115--106712256
40
3.6
38
79
7
126
21
26
23
28
1.99
106712070--106712256
80
2.3
80
79
12
213
23
26
23
26
2.00
106720142--106720228
39
2.2
40
81
6
97
21
28
26
22
1.99
106720197--106720322
40
3.2
39
80
6
139
21
25
24
28
1.99
106720142--106720322
80
2.3
79
79
12
201
22
27
24
25
2.00
106724624--106724732
3
36.7
3
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152
66
1
2
28
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2.0
21
87
12
63
34
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13
47
1.63
106734242--106734295
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3.4
16
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0
99
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14
1.88
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0
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0
0
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0.92
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2.3
18
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11
54
68
0
8
22
1.16
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188
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14
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1.93
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133
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15
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17
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0
52
5
28
0
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2.3
18
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0
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98
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4
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22
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20
29
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106754006--106754124
49
2.4
49
80
8
136
21
28
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
19
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1.98
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0
317
27
29
21
20
1.98
106770223--106770398
46
3.8
46
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12
216
28
29
21
20
1.98
106784475--106784646
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2.1
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13
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16
11
45
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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0
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0
0
16
0.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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2.9
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5
1
40
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433   434   435   436   437   438