Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  202  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62541194--62541226
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2.1
16
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50
18
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0
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1.40
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1.9
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0
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46
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2
50
1.24
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31
2.1
31
84
0
83
26
21
12
39
1.89
62556141--62556249
51
2.2
48
88
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155
27
22
21
28
1.99
62556154--62556249
25
3.8
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84
5
126
28
22
22
26
1.99
62556297--62556343
20
2.3
20
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60
31
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40
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2.3
22
83
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0
0
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0.96
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200
21
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28
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28
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0
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2.2
12
100
0
54
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33
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1.84
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20
2.0
20
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4
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19
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19
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7
32
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1.60
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2.2
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28
1.33
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1.9
30
89
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3
0
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1.13
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55
0
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38
1.23
62594306--62594360
29
1.9
28
85
10
76
61
3
0
34
1.13
62594346--62594401
20
2.9
19
82
12
78
55
0
5
39
1.23
62594334--62594409
20
3.8
20
77
10
75
59
1
3
35
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62594347--62594420
19
3.7
19
75
12
60
60
1
4
33
1.24
62594455--62594505
19
2.7
19
79
11
68
58
1
3
35
1.28
62594688--62594819
9
14.4
9
71
19
87
28
1
2
67
1.12
62594688--62594776
10
9.2
10
70
14
62
30
1
2
66
1.11
62594688--62594819
19
7.2
18
70
16
85
28
1
2
67
1.12
62594695--62594819
27
4.6
27
76
16
107
28
1
2
67
1.13
62594688--62594807
10
12.7
10
69
17
60
30
1
2
65
1.15
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31
2.0
31
90
0
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19
28
14
38
1.90
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20
2.1
21
83
12
54
20
0
20
58
1.40
62602427--62602591
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3.5
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133
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15
30
26
1.96
62611778--62611953
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3.8
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12
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21
21
28
28
1.98
62611775--62611945
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1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
62614903--62614971
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
62614894--62614981
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
62617356--62617531
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
62617353--62617523
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
62621727--62621776
3
16.7
3
91
0
73
26
0
4
70
1.05
62622074--62622153
20
4.1
19
81
12
83
50
1
1
47
1.17
62622081--62622140
19
3.1
19
88
4
84
46
1
0
51
1.10
62622186--62622215
8
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8
95
0
51
63
0
0
36
0.95
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2.0
34
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0
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26
14
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35
1.93
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37
3.3
37
94
0
208
22
33
18
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62631015--62631113
18
5.2
21
59
22
56
21
33
18
27
1.96
62631221--62631484
49
5.4
49
96
0
456
29
32
9
28
1.88
62634160--62634239
30
2.7
30
88
0
115
27
10
23
38
1.87
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12
2.2
12
100
0
54
7
0
25
66
1.17
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22
2.2
21
85
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60
40
0
2
57
1.11
62640762--62640904
40
3.6
40
82
7
166
28
22
21
27
1.99
62640938--62641064
40
3.2
40
78
4
130
30
20
22
25
1.98
62640949--62641158
40
5.3
41
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7
121
31
21
18
28
1.96
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7
35.9
7
67
11
81
23
1
33
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1.66
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27
74
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24
0
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36
1.63
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2.2
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34
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1.82
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2.0
161
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37
11
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28
1.89
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14
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14
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2.6
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17
52
23
28
14
33
1.94
62665759--62665788
8
3.6
8
91
8
51
23
26
13
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62674023--62674128
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2.5
42
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1
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38
23
17
19
1.93
62674140--62674367
88
2.6
87
79
4
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35
20
21
22
1.96
62676651--62676710
26
2.4
24
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8
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68
3
0
28
1.05
62676681--62676739
21
2.8
22
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7
70
69
6
0
23
1.12
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2.9
9
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0
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0
0
19
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0.71
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22
2.2
21
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19
2
10
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1.30
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49
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3
191
25
21
28
23
1.99
62689440--62689511
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2.0
36
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0
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1.97
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22
2.5
22
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9
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13
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35
19
1.91
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2.5
38
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21
27
23
1.99
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24
26
24
2.00
62700166--62700304
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3.5
40
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25
24
28
22
2.00
62701926--62702026
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2.7
38
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4
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42
11
22
22
1.86
62701955--62702026
37
1.9
38
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2
110
45
11
22
20
1.82
62705713--62705813
20
5.1
19
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13
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40
19
26
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1.88
62705714--62705813
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2.5
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40
20
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1.89
62705693--62705815
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2.0
62
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180
38
20
26
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1.92
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19
2.0
20
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33
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2
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2.0
55
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0
179
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1.92
62710554--62710603
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2.4
21
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10
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42
0
8
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1.32
62710931--62710965
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3.8
9
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2
11
1.00
62710931--62710966
19
1.9
18
94
5
63
77
5
2
13
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62713300--62713351
13
3.8
13
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7
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1
1
25
1.07
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33
3.2
33
76
10
108
17
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39
1.85
62717760--62717853
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2.2
43
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24
19
26
1.98
62717760--62717905
43
3.4
42
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10
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32
24
17
25
1.96
62718005--62718058
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1.9
28
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40
24
0
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24
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2.00
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23
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2.00
62726413--62726563
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2.00
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24
23
2.00
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3.8
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22
27
23
26
2.00
62733891--62734041
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1.9
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22
27
23
26
2.00
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43
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23
1.96
62735616--62735774
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16
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1.96
62737592--62737703
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36
1.72
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19
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36
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9
40
1.77
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2.7
55
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212
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12
10
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21.1
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14
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26
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28
1.96
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2.1
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89
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25
26
15
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1.96
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92
0
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26
1.96
62738669--62739029
44
8.2
44
78
9
344
27
27
15
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62738330--62738810
174
2.8
174
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4
580
30
27
15
27
1.96
62738617--62739029
219
1.9
218
91
1
684
29
27
15
27
1.96
62738728--62739053
175
1.9
175
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1
546
27
26
15
30
1.96
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0
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0
11
0
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0.50
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1.80
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0
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2.00
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1.99
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4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438