Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  373  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116333258--116333331
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25
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0
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2.0
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18
26
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1.98
116367138--116367182
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2.0
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0
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17
17
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116367140--116367193
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2.5
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0
63
20
18
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48
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1.9
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86
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162
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3
43
1.36
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20
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0
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1.96
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20
2.7
20
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22
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2.3
23
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25
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0
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0
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51
18
3
3
74
1.11
116433617--116433727
50
2.2
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82
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134
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0.90
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2.8
16
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3
63
15
0
4
79
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
88
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56
19
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1.54
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2.2
65
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28
21
1.96
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2.0
36
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0
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1.9
16
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2.4
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24
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1.9
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20
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16
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0
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21
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4.7
29
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5
157
24
31
15
28
1.96
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2.8
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1
176
23
33
15
27
1.95
116494290--116494584
143
2.1
141
98
1
563
38
29
10
21
1.87
116497987--116498171
40
4.7
40
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25
26
21
25
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2.2
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10
233
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22
26
2.00
116506118--116506301
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4.6
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87
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189
26
27
21
25
1.99
116506146--116506301
39
4.0
40
88
7
205
25
26
21
26
1.99
116506118--116506301
79
2.3
80
81
11
218
26
27
21
25
1.99
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4.0
40
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142
26
20
26
26
1.99
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2.0
36
100
0
146
17
27
19
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.3
37
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0
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33
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1.97
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2.7
46
93
0
201
22
19
27
30
1.98
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130
2.0
130
89
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19
14
33
1.92
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3.2
9
100
0
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1.55
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2.2
30
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0
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23
33
21
1.97
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5.2
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85
0
222
18
9
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19
1.87
116583657--116583695
15
2.6
15
91
0
51
15
23
38
23
1.92
116603513--116603627
43
2.7
43
90
1
187
21
17
27
33
1.96
116610026--116610450
48
8.8
48
78
2
415
28
17
27
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116610026--116610450
96
4.4
96
89
0
598
28
17
27
26
1.97
116611770--116611809
20
2.0
20
85
9
55
5
22
15
57
1.57
116619960--116620097
70
2.0
70
97
0
258
24
7
32
35
1.83
116624792--116624961
85
2.0
85
96
0
313
24
18
12
44
1.84
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26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
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27
4.2
26
82
7
125
38
22
22
16
1.93
116631347--116631458
54
2.1
54
84
3
145
38
22
22
16
1.93
116632854--116632947
24
3.9
24
82
12
104
23
35
5
36
1.78
116635821--116635867
24
2.0
24
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0
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25
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0
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3.8
38
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7
131
21
27
24
26
1.99
116648241--116648370
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23
27
23
24
2.00
116648257--116648408
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3.8
40
79
5
155
21
26
24
26
1.99
116648257--116648406
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
116656779--116656824
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2.7
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10
6
10
1.30
116659888--116659925
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1.9
20
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0
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0
0
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9
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50
0
42
1.31
116661260--116661297
18
2.1
18
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9
60
7
50
0
42
1.31
116666720--116666797
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2.9
27
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0
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30
7
19
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1.79
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4
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27
15
0
57
1.38
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17
2.4
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3
52
55
2
9
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1.44
116680521--116680565
20
2.2
20
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0
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46
0
13
40
1.43
116680632--116680714
34
2.4
34
80
6
87
21
19
22
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116683797--116683927
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4.5
30
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8
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32
13
25
28
1.94
116683797--116683927
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
116685425--116685555
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
116685425--116685555
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
116688028--116688194
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4.2
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2
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24
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22
26
2.00
116689017--116689062
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17
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1.96
116696030--116696196
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185
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22
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2.00
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23
1.96
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28
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1.94
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23
2.00
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0
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1.98
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0
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0
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27
23
26
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1.99
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11
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23
23
26
25
2.00
116738819--116738960
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1
124
27
23
26
21
1.99
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23
2.00
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0
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0
0
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0
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1.97
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1.9
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35
17
27
19
1.94
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2.2
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90
0
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1.89
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0
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2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116762154--116762322
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3.8
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168
29
27
19
23
1.98
116762156--116762341
46
4.1
45
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21
129
29
28
19
23
1.98
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19
2.0
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23
0
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1.55
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1.8
93
93
0
297
28
28
21
21
1.98
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27
20
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1.98
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2.0
30
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0
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5
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1.78
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1.65
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8
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1.76
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2.0
23
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1.65
116789723--116789767
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438