Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  408  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126873610--126873871
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20
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33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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20
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21
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126894022--126894586
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20
22
21
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2
30
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3.2
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200
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1.89
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2.2
22
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26
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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0
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25
1.98
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0
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1.97
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20
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1
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1.10
126993599--126993712
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4
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18
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147
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1
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31
23
23
1.98
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1.9
32
93
0
104
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9
26
26
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.84
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28
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1.88
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28
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1.90
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1.91
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70
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
39
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0
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38
23
24
12
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.02
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0
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2.7
27
78
17
74
32
8
1
57
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438