Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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20
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
5683057--5683380
44
7.5
42
72
7
204
18
21
21
37
1.94
5685766--5685819
18
3.2
15
75
25
54
3
3
46
46
1.38
5685914--5685976
24
2.6
24
82
0
81
33
53
4
7
1.51
5685913--5685952
18
2.2
18
86
0
53
35
52
5
7
1.51
5685932--5686037
30
3.5
30
77
0
95
33
50
6
9
1.60
5691810--5691951
41
3.5
40
83
3
131
40
23
19
16
1.91
5691881--5692129
81
3.2
81
87
8
340
32
24
25
17
1.97
5691840--5692130
41
7.4
41
82
9
345
34
24
23
17
1.96
5691857--5692079
122
1.8
123
89
2
351
31
25
25
17
1.97
5692052--5692114
32
2.0
32
96
0
117
23
22
28
25
1.99
5692297--5692381
21
3.9
21
73
11
80
29
1
24
44
1.61
5692304--5692397
46
2.0
46
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0
161
30
2
24
42
1.66
5692424--5692494
7
10.1
7
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65
19
0
43
36
1.51
5693128--5693162
17
2.0
18
88
5
54
42
14
2
40
1.60
5699122--5699316
43
4.5
43
81
4
214
26
17
28
27
1.98
5700678--5700731
23
2.4
22
84
3
72
29
7
7
55
1.55
5706475--5706615
60
2.4
59
83
9
171
26
26
20
25
1.99
5707243--5707282
8
5.0
8
81
0
53
2
20
22
55
1.56
5707246--5707282
16
2.3
16
95
0
65
2
18
18
59
1.50
5709151--5709195
21
2.0
23
83
8
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2
0
48
1.13
5715496--5715659
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
5715496--5715693
71
2.8
70
89
3
240
20
28
18
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5719684--5720145
213
2.2
213
95
1
818
26
15
21
36
1.93
5720029--5720303
73
3.3
85
74
14
252
25
14
21
37
1.92
5720239--5720268
12
2.5
12
94
0
51
20
6
10
63
1.47
5722233--5722286
23
2.4
22
84
3
72
29
7
7
55
1.55
5726219--5726272
23
2.4
22
84
3
72
29
7
7
55
1.55
5726558--5726599
21
2.0
22
86
9
61
35
4
0
59
1.19
5733036--5733176
60
2.4
59
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9
180
27
26
19
25
1.99
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8
5.0
8
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0
53
2
20
22
55
1.56
5733807--5733843
16
2.3
16
95
0
65
2
18
18
59
1.50
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38
2.0
39
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102
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1
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4
1.20
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2.0
23
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2
0
48
1.13
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3.5
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10
260
26
16
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1.94
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2.0
46
95
0
166
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13
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1.90
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215
1.9
213
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6
489
26
15
21
36
1.93
5744051--5744291
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3.0
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75
14
281
24
15
21
38
1.92
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2.4
44
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3
135
29
22
13
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1.93
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3.5
28
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23
33
16
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1.96
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25
2.0
23
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8
67
6
17
2
74
1.12
5760447--5760493
24
2.0
25
87
8
71
6
17
2
74
1.12
5761387--5761477
26
3.4
26
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12
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62
1
6
29
1.27
5763488--5763610
30
4.2
30
73
14
112
24
8
47
19
1.76
5763503--5763557
27
2.0
27
89
0
83
18
5
50
25
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5763509--5763565
27
2.1
27
86
0
78
19
5
50
24
1.68
5763606--5763640
3
11.7
3
100
0
70
0
0
68
31
0.90
5764345--5764403
21
2.8
22
85
7
70
23
0
6
69
1.12
5764374--5764433
26
2.4
24
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8
75
28
0
3
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1.05
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1.9
35
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26
25
25
23
2.00
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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4.7
46
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19
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1.98
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51
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0
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11
12.6
10
69
18
56
63
2
3
30
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438