Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  79  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21338133--21338200
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2.5
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0
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1.80
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3.7
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112
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1.85
21338189--21338293
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124
30
10
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37
1.87
21338206--21338310
27
3.9
27
75
9
72
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24
27
23
24
2.00
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2.3
80
82
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24
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22
26
2.00
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13
119
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15
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25
1.96
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49
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5
164
29
22
25
22
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15
1.9
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53
40
6
6
46
1.56
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25
2.0
25
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51
0
2
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1.12
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2
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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1.00
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5.8
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29
20
17
32
1.96
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48
5.8
48
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27
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144
1.9
144
81
3
327
26
19
29
24
1.98
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23
3.5
23
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20
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1
18
1.18
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17
2.0
17
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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6
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0
32
1.28
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.3
30
92
0
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27
17
14
39
1.89
21401189--21401277
47
1.9
47
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2
117
5
52
4
37
1.45
21403154--21403231
26
2.9
26
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5
129
3
2
21
71
1.14
21403184--21403234
15
3.7
15
70
20
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3
1
25
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30
2.1
30
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41
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19
1.83
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7.7
77
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18
17
30
1.94
21404263--21404478
79
2.7
78
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5
265
34
17
17
30
1.93
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244
3.4
242
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18
17
28
1.93
21404472--21404824
77
4.7
75
88
3
471
32
18
17
31
1.94
21404472--21404824
149
2.4
148
87
3
485
32
18
17
31
1.94
21404778--21404873
49
2.0
49
97
0
183
32
20
16
30
1.95
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121
2.0
121
94
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417
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15
30
1.93
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2.0
72
97
0
264
34
18
14
32
1.92
21405016--21405121
54
1.9
55
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5
144
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19
14
27
1.90
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13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59
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140
4.5
140
97
1
1168
37
20
17
25
1.94
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54
1.9
54
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135
37
18
15
28
1.91
21405296--21405401
54
1.9
54
85
9
144
37
19
15
27
1.92
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72
2.3
71
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42
19
15
22
1.89
21408217--21408606
195
2.0
195
98
0
753
25
23
21
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21416920--21416979
26
2.3
26
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2
84
6
3
15
75
1.15
21416918--21416979
27
2.2
28
83
8
83
6
3
14
75
1.12
21417613--21417670
30
1.9
30
82
0
71
34
13
20
31
1.92
21418504--21418559
16
3.5
16
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0
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41
7
23
28
1.80
21418541--21418635
46
2.1
46
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9
133
34
4
26
34
1.76
21418794--21418872
34
2.2
38
82
13
96
50
3
1
44
1.28
21422858--21422891
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15
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0
0
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28
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122
43
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10
18
1.82
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1.9
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21
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22
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12
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1.90
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25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
21463782--21463850
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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46
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28
20
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1.98
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0
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182
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27
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1.98
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24
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1.98
21497015--21497426
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1.98
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1.99
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44
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18
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28
1.98
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142
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20
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1.99
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32
0
38
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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1.99
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2.1
96
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277
28
20
26
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21553385--21553616
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20
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24
1.99
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20
19
1.96
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1.99
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118
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22
1.99
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0
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9
0
75
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438