Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  45  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11291401--11291481
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11291652--11291710
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2.1
28
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27
0
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1.47
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21
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28
0
20
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3.3
122
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26
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22
34
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11292020--11292477
122
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26
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1
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3
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1.06
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20
73
18
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29
4
0
64
1.18
11304098--11304171
29
2.6
29
80
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32
4
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1.13
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10
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29
4
0
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1.16
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8
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2.2
48
93
6
184
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17
6
41
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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1.96
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1.9
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10
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3
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2.3
25
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1.90
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2.2
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28
23
14
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1.94
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1.97
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23
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0
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22
23
16
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21
1.98
11372174--11372283
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127
28
20
30
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1.97
11372077--11372333
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2.7
94
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267
28
19
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1.98
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26
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254
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6
24
37
1.80
11377956--11378117
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2.1
78
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290
32
6
24
37
1.80
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26
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25
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239
33
4
24
36
1.76
11383591--11383747
76
2.1
75
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5
255
33
4
24
36
1.76
11385230--11385282
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2.0
26
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22
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1.92
11389945--11390052
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4.2
26
93
0
189
36
24
7
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11396207--11396241
2
17.5
2
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61
48
2
0
48
1.16
11400120--11400223
26
4.0
26
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35
24
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32
1.84
11401578--11401842
47
5.7
46
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10
191
29
20
29
21
1.98
11401677--11401843
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3.6
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10
151
28
20
29
20
1.98
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0
0.00
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20
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1.93
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0
51
1.00
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71
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12
160
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2
4
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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112
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0
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11476690--11476954
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1.99
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
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2.2
18
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12
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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30
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84
48
4
19
27
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438