Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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174
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2.5
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0
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23
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55
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5560968--5561017
22
2.1
23
85
10
66
40
2
2
56
1.22
5562194--5562291
39
2.6
37
77
4
99
54
4
6
35
1.45
5563475--5563898
88
5.0
84
70
16
264
37
19
16
27
1.93
5563649--5563707
30
2.0
30
90
6
93
42
28
8
20
1.81
5563830--5564336
79
6.5
77
71
15
305
32
20
18
29
1.96
5563972--5564143
93
1.8
93
85
2
238
32
19
20
27
1.97
5563912--5564235
170
1.9
164
85
4
443
32
20
18
28
1.96
5563478--5564299
253
3.3
242
82
8
828
35
19
17
28
1.94
5564069--5564336
74
3.6
74
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4
362
31
21
18
28
1.97
5564065--5564336
146
1.8
148
87
3
404
31
20
18
29
1.96
5564293--5564388
49
2.0
49
97
0
183
32
20
16
30
1.95
5564342--5564565
72
3.0
72
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9
299
33
19
16
29
1.94
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121
2.0
121
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0
444
33
19
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1.94
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193
1.9
197
90
4
591
33
19
16
30
1.94
5564614--5564647
13
2.5
13
90
4
50
61
8
8
20
1.52
5564485--5565111
279
2.2
280
94
2
1107
37
20
16
25
1.93
5564485--5565111
140
4.5
140
95
1
1105
37
20
16
25
1.93
5564808--5564913
54
1.9
54
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144
37
19
15
27
1.92
5565050--5565209
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2.2
71
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4
232
40
22
15
22
1.91
5565084--5565328
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2.0
124
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37
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13
24
1.91
5565209--5565381
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33
23
14
28
1.94
5566879--5566954
37
2.1
37
97
0
143
22
25
10
42
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5575369--5575418
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2.2
23
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0
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4
0
26
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1.05
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2.1
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112
28
25
18
28
1.98
5579424--5579488
2
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2
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11
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53
4
0
41
1.21
5579406--5579488
13
6.3
13
73
21
75
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4
0
40
1.22
5579450--5579488
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2.3
17
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53
5
0
41
1.23
5579424--5579511
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2.2
40
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1
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5
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22
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72
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32
1.42
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12
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59
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22
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2.2
22
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106
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5
6
32
1.50
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2.3
22
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3
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2.0
20
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0
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3.1
15
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0
4
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1
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1.10
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0
0
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0.90
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2.0
136
99
0
539
31
24
19
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5585484--5585694
64
3.2
64
62
20
151
29
26
18
26
1.98
5587518--5587653
26
5.2
26
94
0
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36
25
5
33
1.78
5591429--5591639
64
3.2
64
62
20
151
29
26
18
26
1.98
5591395--5591681
137
2.1
137
98
0
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1.98
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0
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1.78
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0
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3.1
44
63
14
111
32
20
24
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438