Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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4.2
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176
24
27
22
25
2.00
5038658--5038808
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1.9
79
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20
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5
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44
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2
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22
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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44
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149
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13
22
27
1.92
5086313--5086446
46
3.0
45
82
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153
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23
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5142979--5143022
19
2.4
18
92
3
70
45
0
9
45
1.35
5142987--5143017
14
2.2
14
100
0
62
48
0
6
45
1.28
5145305--5145358
22
2.5
22
78
0
54
61
5
0
33
1.19
5147549--5147618
31
2.3
30
83
9
81
50
2
2
44
1.31
5147604--5147671
24
2.9
23
75
16
68
60
2
0
36
1.12
5149053--5149115
33
2.0
31
87
6
90
63
0
0
36
0.95
5149066--5149118
11
4.8
11
76
17
56
66
0
0
33
0.92
5149447--5149499
23
2.3
24
80
9
65
41
0
5
52
1.25
5149461--5149508
22
2.2
22
92
7
80
41
0
6
52
1.27
5152256--5152282
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
5152323--5152364
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
5152430--5152510
23
3.4
23
74
10
74
14
1
27
56
1.46
5152471--5152519
25
2.0
25
88
8
73
20
2
24
53
1.56
5152819--5152900
3
27.3
3
73
16
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30
3
1
64
1.18
5152819--5152904
35
2.6
32
76
16
93
31
3
1
63
1.18
5153122--5153164
12
3.5
12
83
3
50
37
0
4
58
1.19
5153101--5153323
125
1.8
121
84
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304
30
4
5
59
1.40
5157607--5157653
9
5.3
9
89
2
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89
0
10
0
0.49
5157607--5157654
8
5.9
8
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7
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0
12
0
0.54
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66
1.9
66
95
0
227
32
19
12
35
1.90
5158959--5159855
44
20.7
43
72
9
513
34
21
22
20
1.96
5159177--5159768
85
6.8
88
75
11
404
34
21
22
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5159266--5159508
131
1.9
128
86
4
344
34
22
23
20
1.97
5158946--5159724
216
3.6
217
96
1
1393
34
21
23
20
1.96
5158947--5159854
132
7.0
131
76
11
608
35
21
22
20
1.96
5159884--5160071
68
2.8
68
87
3
281
29
22
22
25
1.99
5160108--5161097
132
7.5
132
95
1
1743
31
19
23
25
1.98
5160108--5161100
44
22.6
44
73
9
745
31
19
23
25
1.98
5161378--5161404
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
5161445--5161486
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
5161559--5161605
23
2.2
23
85
11
64
12
2
29
55
1.49
5161591--5161639
25
2.0
25
88
8
73
20
2
24
53
1.56
5161937--5162021
3
28.3
3
74
15
70
30
3
1
64
1.17
5162244--5162288
12
3.7
12
84
3
54
37
0
4
57
1.19
5162382--5162415
2
17.0
2
93
0
59
50
2
0
47
1.16
5166291--5166323
12
2.7
13
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13
52
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6
15
15
1.49
5175092--5175210
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2.0
59
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0
229
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16
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31
1.80
5176177--5176208
2
16.5
2
93
6
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53
0
0
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1.00
5180523--5180568
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2.0
23
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2
10
1.51
5181677--5181928
3
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3
69
14
95
27
9
3
59
1.45
5184552--5184585
12
2.9
12
86
4
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32
0
0
67
0.91
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22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
5184809--5184850
11
3.8
11
80
0
57
54
9
14
21
1.68
5186126--5186212
40
2.2
40
85
6
113
34
34
13
17
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5187174--5187229
24
2.3
24
79
8
60
73
1
23
1
1.03
5194498--5194568
24
3.0
25
77
8
85
25
14
16
43
1.86
5194572--5194627
24
2.3
24
84
0
76
39
7
14
39
1.73
5197012--5197062
6
8.5
6
95
0
75
15
21
17
45
1.86
5198145--5198206
23
2.7
23
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2
72
43
4
0
51
1.23
5201511--5201851
102
3.3
102
90
0
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13
12
32
41
1.81
5201694--5202142
45
9.7
45
75
13
376
12
16
30
41
1.85
5201475--5201941
102
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13
12
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1.82
5201778--5202170
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4.4
90
90
0
597
12
17
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40
1.87
5201676--5202170
180
2.7
180
86
3
666
12
16
29
41
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438