Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  211  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65435085--65435150
28
2.4
28
81
0
78
31
25
12
30
1.92
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40
5.2
40
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2
305
25
24
28
21
1.99
65450675--65450884
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
65452904--65452955
26
2.0
26
100
0
104
23
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30
30
1.95
65453629--65453760
48
2.8
48
79
6
142
26
21
27
25
1.99
65455422--65455604
39
4.6
39
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0
231
24
22
30
22
1.99
65458487--65458755
46
5.7
45
72
18
160
22
29
19
28
1.98
65458490--65458754
94
2.8
90
79
13
245
22
29
19
29
1.98
65467753--65467960
40
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39
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3
211
25
25
23
25
2.00
65467753--65467958
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2.6
81
83
4
240
25
26
23
25
2.00
65472011--65472121
24
4.6
24
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3
143
27
17
22
33
1.96
65472011--65472121
48
2.3
48
89
3
170
27
17
22
33
1.96
65473946--65474010
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2.0
32
100
0
130
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1.85
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22
2.0
22
83
8
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4
0
57
1.19
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43
1.9
43
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4
123
21
20
31
26
1.98
65477700--65477770
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2.1
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22
12
23
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1.88
65477700--65477755
16
3.4
16
70
18
51
19
16
26
37
1.92
65482041--65482266
21
9.9
21
76
17
202
33
9
29
28
1.88
65482060--65482236
27
7.2
27
72
21
174
32
10
29
28
1.90
65482041--65482266
48
4.8
48
91
3
347
33
9
29
28
1.88
65482041--65482268
69
3.3
64
75
18
210
32
9
29
28
1.88
65486475--65486616
40
3.5
40
80
7
137
22
28
24
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65497723--65497779
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2.1
27
100
0
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24
10
19
45
1.81
65500533--65500571
13
2.9
14
88
11
55
87
5
0
7
0.68
65500535--65500570
17
2.2
16
90
5
54
91
2
0
5
0.49
65502637--65502670
18
1.9
18
94
5
61
38
11
5
44
1.65
65504599--65504722
48
2.6
48
89
0
176
24
16
32
26
1.96
65506726--65506780
22
2.5
22
100
0
110
16
29
40
14
1.88
65509050--65509241
49
3.9
49
95
0
312
28
9
33
28
1.88
65509211--65509269
28
2.1
28
100
0
118
25
6
38
28
1.81
65509394--65509477
37
2.3
36
93
2
141
25
17
34
22
1.96
65511085--65511118
10
3.6
10
84
15
54
0
8
0
91
0.43
65512171--65512426
47
5.4
47
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1
406
28
32
6
33
1.83
65516211--65516378
40
4.2
40
82
2
196
25
27
22
25
2.00
65523540--65523623
28
3.0
27
84
8
105
20
4
27
47
1.70
65523828--65523932
21
5.0
21
81
3
104
15
22
24
37
1.93
65525015--65525201
46
3.9
48
74
15
154
26
15
28
29
1.96
65533440--65533565
48
2.6
48
88
0
189
23
16
31
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1.96
65537507--65537551
16
2.7
17
83
13
58
75
0
17
6
1.01
65537496--65537550
22
2.5
20
78
18
56
74
0
18
7
1.04
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10
4.4
10
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54
13
22
22
42
1.88
65538644--65538692
21
2.4
20
86
3
62
12
20
22
44
1.84
65545522--65545876
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71
13
182
27
19
27
25
1.99
65545520--65545733
94
2.3
94
84
4
263
28
18
26
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65545616--65545877
142
1.9
139
84
7
359
26
18
28
26
1.98
65552709--65552811
29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
65555103--65555179
37
2.1
37
92
0
127
22
33
19
24
1.97
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47
13.3
47
94
0
1009
27
29
10
32
1.89
65555347--65555425
25
3.3
25
67
16
76
30
29
6
34
1.82
65562687--65562801
43
2.7
43
75
9
119
26
16
25
32
1.96
65564943--65565105
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4.2
39
92
0
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24
32
20
22
1.98
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4.9
39
90
0
251
23
31
21
23
1.98
65572924--65573086
39
4.2
39
93
0
263
24
31
20
23
1.98
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1.8
93
94
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29
21
20
1.98
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28
29
20
20
1.98
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2.1
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23
19
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1.98
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0
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2
137
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28
14
27
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21
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1.8
92
96
0
313
21
21
28
28
1.99
65611182--65611354
46
3.7
46
78
13
210
21
21
27
28
1.99
65611179--65611349
93
1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
319
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0
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31
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29
1.96
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1.9
22
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5
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31
0
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1.56
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42
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0
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1.96
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2.1
90
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2
205
26
26
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28
1.98
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42
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5
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26
1.96
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2
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25
1.94
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2.0
257
94
0
910
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1.84
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40
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26
1.99
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1.8
108
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23
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1.96
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6
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25
18
27
28
1.98
65649191--65649420
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300
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19
26
28
1.98
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0
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1.95
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1.95
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0
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19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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1.34
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27
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1.83
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2
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27
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1.95
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27
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1.96
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100
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16
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0
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13
16
13
55
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65766542--65766681
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4.9
29
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1.93
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27
1.93
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0
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1.81
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22
1.99
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27
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1.99
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28
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1.99
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30
90
0
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30
25
8
36
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438