Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  196  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60881765--60881832
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2.5
27
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0
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60881765--60881841
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2.4
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3.3
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124
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1.83
60887336--60887459
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1.9
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153
21
45
12
19
1.83
60887859--60888015
64
2.5
62
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197
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46
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11
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2
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1.17
60891446--60892136
10
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10
70
11
317
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2
56
0
1.17
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393
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1
56
0
1.17
60891447--60892136
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243
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2
56
0
1.17
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16
3.6
17
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47
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16
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2
41
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19
2.1
19
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0
62
32
0
5
62
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
91
0
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24
12
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1.89
60912433--60912467
18
1.9
18
100
0
70
28
11
22
37
1.89
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9
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9
94
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45
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10
30
1.77
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19
2.5
19
82
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36
4
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2.0
24
100
0
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8
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0
0
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1.38
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1.78
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27
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24
18
1.96
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54
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24
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0
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24
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0
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53
14
4
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1.60
60927324--60927377
17
3.2
17
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15
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57
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1.49
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1.54
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10
6.8
10
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31
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2
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1.08
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31
1
1
65
1.13
60928691--60928749
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2.7
21
73
19
57
32
1
1
64
1.13
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16
3.9
16
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79
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27
1.82
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16
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16
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73
38
5
26
29
1.78
60931881--60932042
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2.3
71
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19
27
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2.8
70
89
4
238
20
28
17
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60935722--60935884
70
2.3
71
98
1
319
19
28
17
34
1.94
60942835--60942903
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73
14
52
31
0
2
65
1.08
60942819--60942878
25
2.3
26
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31
1
1
65
1.13
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22
2.7
21
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32
1
1
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1.13
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16
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29
27
1.82
60943062--60943136
16
4.8
16
85
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73
38
5
26
29
1.78
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2.3
71
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0
310
18
28
18
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249
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28
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1.96
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26
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23
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1.83
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50
24
18
22
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21
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4
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1.17
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5
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54
58
2
2
37
1.24
60989808--60989893
38
2.2
39
77
2
93
30
5
5
58
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60989914--60990009
9
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9
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74
32
2
1
64
1.12
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26
2.4
27
77
17
78
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20
19
39
1.92
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0
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29
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20
1.98
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46
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27
29
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20
1.98
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30
3.0
30
79
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17
10
1.67
61013279--61013361
15
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61013290--61013367
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15
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11
1.69
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1.98
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46
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233
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29
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20
1.98
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2.0
26
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26
1.98
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10
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1.88
61020114--61020311
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2.0
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1.90
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1
0
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1.03
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0
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0
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0
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1.89
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28
2.1
28
96
0
111
30
21
10
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
57
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0
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48
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18
27
1.98
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24
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18
28
1.98
61038616--61038945
144
2.3
144
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2
466
24
29
18
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1.98
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482
4.7
482
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1
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2.0
331
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2
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2
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115
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1.51
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1.60
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3.7
40
80
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153
30
18
22
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
61067109--61067201
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397
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18
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1.95
61067709--61068140
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131
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346
26
20
18
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1.96
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1.96
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93
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1.98
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3.8
46
80
10
205
28
29
20
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          433   434   435   436   437   438