Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  63  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16411381--16411424
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0
0
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20
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20
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19
80
8
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2
2
30
1.18
16411554--16412581
249
4.0
251
81
8
1172
47
10
8
32
1.69
16411564--16412712
509
2.2
526
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1518
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10
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32
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0
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0
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1.64
16412581--16412640
20
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2
2
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59
2
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1.19
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26
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0
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201
32
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36
1.80
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2.0
26
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20
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26
1.92
16425265--16425317
25
2.2
24
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3
79
16
22
20
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
24
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22
19
41
1.90
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9
6.2
10
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9
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3
58
1.31
16428808--16428851
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15
80
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54
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0
0
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0
0
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2.5
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17
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23
2.0
23
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16445310--16445354
23
2.0
23
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2.0
254
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1.89
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4.5
38
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21
22
25
30
1.98
16452158--16452282
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45
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2
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1.99
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57
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49
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0
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35
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0
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39
1.12
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0
0
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2.5
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49
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2
44
1.32
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126
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3.0
24
77
10
65
54
0
1
43
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16476280--16476365
27
3.1
27
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1.34
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2.2
25
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3
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1.14
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2.5
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2
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1.31
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0
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1.26
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1.20
16497287--16497439
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1
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1.20
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16497290--16497401
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28
23
1.98
16537035--16537438
48
8.5
49
68
15
165
28
18
28
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16538554--16538632
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1.9
41
89
5
124
18
24
39
17
1.92
16541119--16541174
19
2.9
20
81
7
71
26
17
10
44
1.82
16549054--16549441
44
8.8
44
72
11
224
29
16
23
29
1.96
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132
2.4
132
81
6
350
29
17
23
29
1.97
16549052--16549432
88
4.3
88
73
9
292
29
16
24
29
1.96
16549052--16549448
177
2.2
176
82
4
469
30
16
23
29
1.96
16555578--16555653
39
2.0
39
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59
2
13
25
1.47
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8
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0
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0
0
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4
0
35
1.16
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2
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1.95
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0
3
21
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2.1
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0
4
19
0.96
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10
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0
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1.03
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0
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1.97
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25
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0
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0
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0
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21
1.91
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27
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24
18
1.96
16589495--16589635
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2.6
54
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2
248
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24
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1.95
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26
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0
189
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24
7
32
1.83
16596544--16596621
27
2.9
26
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7
104
34
21
25
17
1.96
16598235--16598341
26
4.2
26
89
2
171
37
24
5
32
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16598235--16598341
51
2.1
52
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1
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5
32
1.79
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10
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0
0.84
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2.7
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0
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28
22
25
23
1.99
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40
3.2
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8
141
22
24
29
23
1.99
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2.7
40
82
0
124
28
22
25
23
1.99
16609436--16609562
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3.2
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83
8
141
22
24
29
23
1.99
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13
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0
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0
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0
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25
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16
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0
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0
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1.95
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115
28
18
25
28
1.98
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20
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0
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2.4
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101
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0
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1.86
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0
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0
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4
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2
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0
0
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1.00
16682811--16682851
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0
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3
30.3
3
73
18
59
64
1
4
29
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16683204--16683293
12
7.5
12
78
18
73
64
1
4
30
1.20
16683200--16683294
18
5.1
18
77
11
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1
4
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1.19
16683784--16683842
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2.0
30
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0
100
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1.70
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22
23
26
2.00
16684227--16684528
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2.2
135
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421
27
22
23
26
2.00
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2
1979
20
23
20
35
1.96
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22
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1.97
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132
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0
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22
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1.97
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1.97
16686864--16687095
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2.6
88
91
0
367
26
27
18
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438