Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  97  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27353067--27353485
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29
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0
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10
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38
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24
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24
2.00
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4.6
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2.00
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25
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2.00
27427668--27427833
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2.1
80
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2
226
25
22
25
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
2.00
27435772--27435961
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2.4
80
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24
2.00
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2.0
127
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4
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20
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22
24
1.99
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2.3
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22
29
22
25
1.99
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18
24
29
1.98
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1.9
100
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25
21
25
1.99
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5.1
40
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1
271
22
22
28
26
1.99
27478352--27478557
80
2.6
80
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306
23
22
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1.99
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20
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20
20
1.54
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1.94
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18
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1.92
27481216--27481250
14
2.5
14
95
0
61
57
2
20
20
1.54
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1.94
27481552--27481586
14
2.5
14
95
0
61
57
2
20
20
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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670
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16
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6.9
336
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3005
34
19
16
29
1.94
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2.3
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35
16
15
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1.90
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14
2.5
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90
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60
2
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20
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1.48
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19
15
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1.93
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148
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654
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3.7
101
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1.94
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4
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40
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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28
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21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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0
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45
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438