Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   

This is table  383  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119395900--119395987
20
4.7
20
68
22
73
65
7
0
26
1.19
119395901--119396018
56
2.1
56
93
4
204
65
11
0
23
1.24
119405191--119405226
2
18.0
2
94
0
63
52
0
0
47
1.00
119407790--119407836
23
2.1
22
84
11
60
4
19
0
76
0.95
119407819--119407857
19
2.0
21
90
10
64
10
17
0
71
1.12
119407806--119407847
16
2.5
17
82
14
52
7
16
0
76
1.00
119407799--119407857
19
3.1
19
79
16
61
8
18
0
72
1.09
119408061--119408093
12
2.6
13
85
9
50
54
24
6
15
1.63
119409447--119409527
11
6.8
12
78
12
53
62
1
3
32
1.20
119409431--119409519
39
2.3
39
82
7
110
62
1
4
31
1.22
119409419--119409528
7
16.3
7
68
14
61
62
1
3
31
1.23
119409491--119409527
11
3.5
11
88
7
58
67
0
0
32
0.91
119409468--119409527
21
2.8
22
82
7
70
66
0
3
30
1.07
119409535--119409595
26
2.3
26
83
10
72
40
1
4
52
1.33
119409556--119409606
26
2.0
27
81
11
63
45
1
5
47
1.38
119419016--119419084
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
119423290--119423351
27
2.3
27
97
0
115
17
9
29
43
1.81
119429438--119429504
27
2.5
28
78
9
77
16
17
14
50
1.78
119429669--119429754
45
1.9
45
85
4
120
25
22
10
41
1.85
119430743--119430792
15
3.3
15
81
10
66
34
22
8
36
1.83
119430735--119430792
30
1.9
30
96
0
107
34
22
8
34
1.85
119443854--119443950
34
2.8
34
80
9
108
28
21
24
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119447995--119448038
22
2.0
22
100
0
88
31
18
18
31
1.95
119460276--119460351
34
2.2
34
85
0
98
28
22
22
26
1.99
119471791--119471951
46
3.5
44
77
13
148
29
19
26
24
1.98
119471978--119472107
49
2.7
49
79
7
140
28
20
27
23
1.99
119488810--119488995
40
4.7
40
77
7
171
24
25
24
25
2.00
119493179--119493341
46
3.6
45
85
8
206
33
17
26
22
1.96
119493381--119493491
49
2.3
49
78
6
118
32
21
26
19
1.97
119496098--119496148
25
2.0
25
96
0
93
23
31
7
37
1.83
119497971--119498022
18
2.7
19
88
5
70
53
3
7
34
1.48
119498151--119498193
20
2.2
20
87
8
61
74
0
25
0
0.82
119498153--119498195
22
2.0
21
82
13
52
72
0
27
0
0.85
119498119--119498192
12
6.1
12
71
16
55
68
0
25
5
1.10
119508568--119508632
30
2.2
30
88
5
96
21
32
21
24
1.98
119510346--119510432
43
2.0
43
100
0
174
44
20
2
32
1.64
119512686--119512737
18
2.7
19
88
5
70
53
3
7
34
1.48
119512740--119512797
24
2.5
22
75
10
53
44
1
1
51
1.21
119512795--119512848
17
3.0
18
83
8
56
74
1
9
14
1.15
119512862--119512904
20
2.2
20
87
8
61
74
0
25
0
0.82
119512864--119512906
22
2.0
21
82
13
52
72
0
27
0
0.85
119512832--119512903
12
5.9
12
70
16
51
69
0
25
5
1.10
119513769--119513901
40
3.4
40
73
7
128
26
16
24
33
1.96
119515031--119515074
22
2.0
22
95
0
79
45
15
4
34
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119515070--119515144
6
12.0
6
76
12
62
9
13
1
76
1.09
119515094--119515144
19
2.8
18
82
11
61
7
13
1
76
1.09
119517111--119517173
24
2.6
24
82
7
74
34
28
14
22
1.93
119522421--119522530
55
2.0
54
96
1
202
24
19
17
39
1.92
119523724--119523824
3
34.7
3
78
13
104
34
0
2
62
1.11
119524073--119524142
33
2.1
33
82
10
81
41
1
5
51
1.34
119524098--119524164
33
2.0
33
83
11
84
47
0
7
44
1.31
119524286--119524337
15
3.4
14
79
12
50
71
1
3
23
1.13
119525590--119525756
24
7.0
23
86
6
210
26
22
22
28
1.99
119525590--119525756
47
3.5
47
86
6
221
26
22
22
28
1.99
119525591--119525757
71
2.3
71
88
5
239
26
22
23
28
1.99
119525802--119525872
20
3.5
20
90
0
115
32
19
11
36
1.87
119525909--119525956
25
2.0
24
83
4
60
25
18
25
31
1.98
119527192--119527315
27
4.6
27
82
3
133
40
11
20
28
1.86
119527143--119527306
54
3.0
55
77
3
129
37
10
21
29
1.88
119527164--119527315
81
1.9
81
81
2
189
38
12
20
28
1.89
119527193--119527316
54
2.3
54
85
2
178
39
11
20
28
1.87
119530411--119530577
24
7.0
23
87
6
219
25
22
23
28
1.99
119530411--119530577
47
3.5
47
86
6
230
25
22
23
28
1.99
119530412--119530578
71
2.3
71
89
5
248
25
22
23
28
1.99
119530635--119530691
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
119530623--119530693
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119530628--119530682
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
119530730--119530777
25
2.0
24
83
4
60
25
18
25
31
1.98
119532013--119532137
27
4.6
27
81
3
108
40
10
20
29
1.85
119532015--119532138
54
2.3
54
84
2
169
39
10
20
29
1.86
119533973--119534092
45
2.5
50
76
16
133
21
19
18
40
1.91
119533988--119534094
45
2.4
45
87
0
151
22
17
17
42
1.89
119540124--119540152
2
15.0
2
92
7
51
48
0
0
51
1.00
119540157--119540207
3
17.3
3
78
11
52
35
0
3
60
1.15
119540157--119540205
16
3.0
17
79
8
57
34
0
4
61
1.15
119540445--119540538
33
2.6
37
74
22
92
43
1
4
51
1.28
119540467--119540547
33
2.5
33
82
11
87
46
0
6
46
1.27
119540679--119540728
22
2.4
20
81
12
64
76
4
6
14
1.13
119541794--119541903
45
2.4
45
84
3
141
21
17
19
41
1.90
119541883--119541930
18
2.6
18
76
3
51
22
22
16
37
1.94
119542564--119542594
15
2.1
15
100
0
62
12
0
32
54
1.38
119542569--119542603
15
2.3
15
90
0
52
20
2
28
48
1.63
119543795--119543824
3
9.7
3
92
7
51
33
0
0
66
0.92
119544751--119544813
3
21.0
3
100
0
126
66
0
0
33
0.92
119546585--119546642
8
6.7
9
75
13
50
62
0
1
36
1.06
119546600--119546650
17
2.9
17
82
2
57
58
1
1
37
1.20
119550645--119551045
203
2.0
200
83
4
502
23
20
13
42
1.87
119554762--119554794
17
1.9
18
88
11
52
42
9
0
48
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119559445--119559493
24
2.0
24
88
0
71
38
2
6
53
1.38
119559453--119559504
24
2.2
24
89
0
77
36
1
3
57
1.28
119564947--119564997
21
2.7
18
83
16
75
43
21
5
29
1.76
119564954--119564998
21
2.1
21
100
0
90
44
24
4
26
1.72
119572436--119572497
18
3.4
18
78
14
65
35
22
24
17
1.95
119573385--119573440
29
1.9
29
88
0
85
35
8
17
37
1.82
119574447--119574570
63
2.0
64
86
1
178
40
17
11
30
1.85
119577626--119577658
16
2.1
16
94
0
57
27
39
12
21
1.88
119582182--119582217
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
119586975--119587017
22
1.9
23
85
4
61
41
23
13
20
1.88
119587452--119587492
14
2.9
14
80
20
50
14
19
0
65
1.26
119589319--119589360
12
3.6
12
83
6
59
21
0
9
69
1.17
119589357--119589402
21
2.1
22
84
11
60
21
4
0
73
1.00
119603094--119603167
37
2.0
37
82
15
91
27
8
22
41
1.82
119618794--119618867
37
2.0
37
82
15
91
27
8
22
41
1.82
119618532--119619608
537
2.0
537
96
0
1965
27
13
22
37
1.91
119624315--119624371
23
2.4
23
91
2
87
31
33
7
28
1.84
119636584--119636759
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
119636581--119636752
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
119644135--119644305
93
1.8
92
94
1
306
21
21
29
28
1.98
119644139--119644312
46
3.8
46
78
13
205
20
20
29
28
1.98
119650497--119650542
20
2.2
20
80
3
56
34
21
36
6
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119650344--119650838
254
1.9
255
89
1
760
29
24
30
16
1.96
119650752--119650796
20
2.2
20
84
4
54
35
22
35
6
1.80
119651332--119651384
26
2.1
24
82
6
61
15
5
1
77
1.04
119658421--119658522
51
2.0
51
94
1
177
36
23
8
31
1.86
119658419--119658525
26
4.2
26
89
2
171
36
23
8
31
1.85
119660564--119660621
29
2.0
29
100
0
116
27
27
10
34
1.89
119665533--119665639
26
4.2
26
89
2
171
36
22
8
32
1.84
119665533--119665639
51
2.1
51
92
1
178
36
22
8
32
1.84
119668431--119668682
90
2.8
90
80
5
280
20
17
15
46
1.85
119668431--119668637
45
4.6
44
83
4
236
20
17
14
46
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438