Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  421  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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152
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33
19
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1.9
54
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2.3
71
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15
22
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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146
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491
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1.97
130450322--130450662
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4.7
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421
33
21
18
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144
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21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.92
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3.5
17
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39
9
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34
1.82
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19
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10
94
38
11
14
35
1.82
130552857--130552904
19
2.5
19
75
25
55
41
8
16
33
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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4
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42
6
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1.73
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1.9
17
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5
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0
0
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0
341
33
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23
24
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2.2
220
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0
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25
1.98
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1
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25
1.94
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310
29
15
28
26
1.96
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5.9
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14
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26
1.95
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0
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20
1.98
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28
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0
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1.99
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2.2
23
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49
0
7
43
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.8
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2
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2.3
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90
5
52
62
2
2
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130613833--130613875
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21
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2
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1.33
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0
0
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0
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20.5
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100
0
82
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438