Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  75  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20127340--20127370
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14
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5
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9
0
45
1.36
20132150--20132201
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0
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2.0
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0
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2.0
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0
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0
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0
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0
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0
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2.0
21
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205
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409
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22
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20142269--20142802
250
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24
22
23
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0
82
0.81
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12
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3
13
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0.80
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26
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2.9
37
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200
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100
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22
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28
2.1
28
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1
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20160923--20160975
19
2.7
21
77
14
67
47
0
3
49
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20160945--20161026
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2.6
31
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5
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1
6
52
1.34
20161320--20161386
27
2.5
27
97
0
125
34
8
8
47
1.66
20172394--20172509
43
2.7
43
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112
22
14
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30
2.2
30
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0
85
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30
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5
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0
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20
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20
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27
2.1
27
100
0
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45
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16
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1.31
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2.9
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11
20
42
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20187940--20188229
29
10.1
29
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15
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1.93
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58
2.2
58
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182
23
16
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2.1
18
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0
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1.10
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2
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2
93
0
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0
45
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20199080--20199106
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14
100
0
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0
0
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18
100
0
74
10
27
27
35
1.90
20204628--20204669
21
2.0
21
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59
21
9
21
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24
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24
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138
20
16
27
34
1.94
20206774--20206878
48
2.3
44
83
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122
23
17
25
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1.96
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24
2.6
24
94
0
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20
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1.9
54
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11
135
18
23
28
29
1.98
20226419--20226594
46
3.8
46
75
10
187
22
21
27
28
1.99
20226416--20226587
93
1.8
93
91
0
281
23
21
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20233988--20234058
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2.0
36
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0
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14
21
22
1.88
20254259--20254515
40
6.5
40
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3
324
23
22
27
26
2.00
20254259--20254515
119
2.2
119
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4
331
23
22
27
26
2.00
20257762--20257830
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
20259443--20259480
20
1.9
20
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0
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2
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1.50
20261245--20261354
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4.2
26
92
0
175
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5
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1.78
20271338--20271578
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2
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23
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2.00
20271356--20271579
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290
25
28
23
23
2.00
20271356--20271578
119
1.9
119
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25
28
23
23
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27
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12
100
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15
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1.83
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1
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13
44
1.82
20285159--20285199
15
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17
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28
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27
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29
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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T
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1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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18
27
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438