Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  235  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72789972--72790306
96
3.5
96
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3
431
27
26
16
29
1.97
72789976--72790306
144
2.3
144
84
3
423
27
26
16
29
1.97
72796397--72796521
19
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19
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12
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72796940--72796984
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2.0
23
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2
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2.0
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0
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18
18
1.70
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38
1.44
72812541--72812573
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2.1
16
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5
50
0
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1.30
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0
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27
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40
90
1
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27
28
20
23
1.99
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40
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26
23
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22
2.00
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2.4
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4
186
23
24
29
22
1.99
72843731--72843914
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
72843771--72843959
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
72846856--72846946
46
2.0
46
84
0
119
26
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1.85
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22
3.3
22
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23
27
13
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1.92
72846960--72847363
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0
592
25
27
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33
1.92
72847247--72847319
22
3.2
22
65
24
60
24
30
13
31
1.94
72846988--72847409
141
3.0
139
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2
389
28
27
11
32
1.92
72858738--72858951
40
5.7
40
81
8
157
21
31
22
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72858768--72858950
39
4.9
39
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9
247
21
31
22
24
1.98
72858768--72858951
75
2.5
73
85
9
239
21
31
22
24
1.98
72866831--72866981
39
3.9
39
93
2
250
22
31
21
23
1.98
72866831--72866981
77
1.9
79
91
2
252
22
31
21
23
1.98
72874161--72874353
39
4.9
39
89
1
271
23
32
20
23
1.98
72874161--72874355
77
2.5
78
89
4
277
23
31
20
24
1.98
72887248--72887288
21
2.0
21
85
9
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19
0
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1.50
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2.0
88
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307
25
12
14
46
1.80
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29
4.6
29
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1
149
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16
32
25
1.96
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29
4.6
29
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3
140
24
16
32
25
1.96
72898374--72898445
28
2.5
29
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2
128
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15
30
27
1.96
72900733--72900984
38
6.5
40
87
5
324
24
28
24
22
1.99
72900733--72900984
79
3.2
79
86
7
340
24
28
24
22
1.99
72901602--72901636
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1.9
18
100
0
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40
20
0
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1.52
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40
6.5
40
89
2
360
24
28
23
22
2.00
72913596--72913645
20
2.5
20
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9
57
30
0
6
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1.18
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17
2.7
15
80
13
50
51
20
13
13
1.76
72921117--72921644
50
10.7
45
72
11
191
30
24
18
26
1.98
72921160--72921738
101
5.8
99
78
5
470
30
24
18
26
1.98
72921109--72921589
151
3.2
149
85
4
564
30
25
18
25
1.98
72921161--72921738
252
2.3
250
89
2
879
30
24
18
26
1.98
72921211--72921747
151
3.5
151
85
2
546
30
24
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72933884--72934203
48
6.7
48
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2
403
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25
1.97
72933917--72934204
96
3.0
96
91
2
454
26
29
18
25
1.98
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23
1.9
23
95
0
79
56
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6
22
1.61
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21
2.0
22
85
4
59
38
7
19
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1.79
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300
3.0
300
96
0
1697
39
7
15
37
1.76
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2.4
13
100
0
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22
19
12
45
1.84
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25
2.2
25
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1.41
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2.0
25
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1.40
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17
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11
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43
0
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1.37
72974658--72974738
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153
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43
0
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1.37
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16
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29
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20
20
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48
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31
25
6
36
1.82
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50
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9
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26
9
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1.87
73013585--73013660
22
3.3
22
65
28
59
25
31
13
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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27
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3.1
94
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3
377
26
27
10
34
1.90
73020492--73020647
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5.8
27
92
0
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1.81
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54
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0
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1.83
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27
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9
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1.83
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29
1.84
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1.82
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1.84
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33
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
25
0
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0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
0
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21
10
21
46
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438