Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  365  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113927597--113927847
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12
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0
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0
0
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19
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180
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0
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17
20
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2.1
362
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1
989
33
17
20
28
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2.4
219
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0
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21.3
12
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2
58
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10
0
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1.33
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10
101
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3.4
364
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1157
24
22
17
35
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3.5
120
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330
20
20
21
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1.9
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2.1
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0
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2.2
12
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0
54
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0
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59
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
32
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2.9
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23
17
30
1.97
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2.5
24
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0
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113961992--113962022
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0
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0
0
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0
0
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25
1.98
113980781--113980917
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3.2
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11
131
31
26
16
25
1.97
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43
3.7
43
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169
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19
25
30
1.98
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0
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21
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1.99
113998111--113998143
13
2.6
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50
39
0
12
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114003512--114003590
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13.3
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70
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2.4
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10
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31
1.80
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82
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1.88
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38
25
11
24
1.88
114014693--114014990
27
11.1
27
87
0
375
28
21
8
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114014698--114014990
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3.6
81
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2
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29
21
8
41
1.82
114015497--114015560
25
2.6
25
92
0
101
17
20
15
46
1.83
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20
59
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18
15
47
1.83
114017510--114017787
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10.3
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2
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39
20
8
31
1.83
114017510--114017687
54
3.3
53
91
0
275
40
20
7
31
1.80
114017510--114017787
81
3.5
79
81
7
294
39
20
8
31
1.83
114017767--114018038
27
10.1
27
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1.82
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18
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47
1.82
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2.7
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19
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1.9
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13
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4
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25
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3.0
33
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0
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21
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26
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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2.0
31
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
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28
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42
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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0
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17
16
34
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438