Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2
27
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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75
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4
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2.1
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2.1
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30
8
17
43
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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43
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1
5
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7
1
49
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6942119--6942157
20
2.0
20
90
10
62
58
2
2
35
1.25
6942946--6942993
23
2.1
23
100
0
96
47
4
8
39
1.53
6946081--6946135
22
2.5
23
82
8
69
29
1
5
63
1.27
6946267--6946453
3
62.3
3
75
12
127
29
8
1
61
1.31
6959292--6959331
19
2.0
20
85
9
55
50
7
5
37
1.53
6959560--6959624
23
2.5
24
79
18
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53
4
6
35
1.46
6959560--6959640
25
3.2
24
73
23
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53
3
8
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1.50
6959680--6959744
20
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19
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20
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7
31
1.57
6959847--6959916
25
2.8
25
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4
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73
3.0
73
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18
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1.96
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89
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16
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1.92
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32
20
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43
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43
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21
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6974899--6974938
19
2.0
20
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20
3.1
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2.4
18
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25
1.30
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23
2.2
25
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1.47
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24
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8
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1.57
6975170--6975306
25
5.7
23
70
21
84
53
6
8
31
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6975270--6975319
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2.5
20
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9
57
62
10
0
28
1.27
6975414--6975483
23
3.2
20
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8
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31
1.59
6975417--6975526
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5
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1.51
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3.8
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0
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0
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28
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57
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1.9
281
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4
803
27
22
17
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6993853--6993883
12
2.7
11
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9
53
29
0
0
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2.1
22
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0
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5
0
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0
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0
0
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0
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0
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438