Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  424  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131218957--131219120
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71
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0
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3.1
41
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28
98
32
17
28
21
1.96
131226530--131226693
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
131229659--131229689
16
1.9
16
100
0
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45
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6
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1.63
131235387--131235417
16
1.9
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93
0
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48
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3
38
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131237342--131237400
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2.4
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2.2
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84
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131251710--131251757
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2.4
19
86
10
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31
2
0
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1.9
40
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32
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2.2
18
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0
60
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2.1
21
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67
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1.10
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63
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0
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1.16
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18
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19
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25
53
63
5
0
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1.17
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26
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27
25
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19
2.4
19
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44
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4
37
1.64
131261020--131261067
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41
0
2
56
1.11
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4.5
12
78
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43
0
1
54
1.11
131262343--131262392
15
3.4
15
88
2
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36
2
12
50
1.51
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9.0
21
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4
307
15
27
26
30
1.96
131262765--131262956
44
4.4
43
94
2
307
15
27
27
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131263143--131263183
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2.2
19
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0
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29
1.53
131264357--131264397
20
2.1
19
90
4
64
41
17
2
39
1.62
131265199--131265248
25
2.0
25
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7
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32
1.81
131269831--131269875
22
2.0
22
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0
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1.19
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17
2.1
17
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10
54
54
0
11
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2.0
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1
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1.9
22
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57
34
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7
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2.4
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30
5
7
57
1.48
131281533--131281575
18
2.3
19
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25
6
13
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28
2.3
28
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0
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3
1.21
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20
28
1.99
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2.7
40
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123
25
24
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29
1.99
131284456--131284506
21
2.4
21
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57
54
21
0
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1.44
131284574--131284606
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0
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0
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45
1.35
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19
3
0
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0.90
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3.3
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91
8
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19
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0
77
0.90
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2.5
367
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15
10
38
1.82
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2.8
24
84
10
93
26
19
7
46
1.76
131294824--131294879
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15
80
20
73
46
0
0
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1.00
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9
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74
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12
0
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163
48
13
0
37
1.48
131294963--131295122
42
3.7
43
76
5
126
48
13
1
36
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131303271--131303346
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2.6
29
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22
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1.96
131306816--131306872
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3.2
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7
62
63
5
0
31
1.17
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12
3.2
12
85
3
51
71
0
10
17
1.12
131306926--131306971
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2.0
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0
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32
1.05
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3.6
11
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10
53
68
0
2
28
1.03
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5.6
7
93
0
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41
15
2
41
1.61
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2.8
19
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0
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1.35
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12
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17
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1.73
131326033--131326261
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2
271
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6
17
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1.73
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3.0
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0
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14
2.9
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
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0
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4
46
22
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438