Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  415  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128802487--128802515
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15
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0
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0
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1
15
1.49
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0
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2.0
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0
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1.45
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14
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0
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0
0
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0
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2.0
50
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1.01
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70
30
0
4
65
1.13
128863453--128863491
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2.4
16
91
0
60
33
7
28
30
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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2.2
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10
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51
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0
43
1.26
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17
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1.10
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1.00
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1
78
0.97
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80
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379
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22
1.76
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2.0
20
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28
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0
50
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1.22
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75
58
0
3
38
1.14
128883654--128883824
10
17.4
9
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22
53
57
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33
1.34
128883767--128883823
30
1.9
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86
10
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3
3
33
1.31
128884098--128884154
19
2.8
21
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24
59
59
0
3
36
1.14
128884105--128884140
18
1.9
19
88
5
56
63
0
5
30
1.17
128884098--128884162
10
6.7
9
78
18
60
60
0
4
35
1.18
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100
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0
0
50
1.00
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2.0
16
93
0
55
71
0
0
28
0.86
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20
14
29
35
1.93
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4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128898767--128898937
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2.4
75
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7
221
31
11
23
33
1.90
128906201--128906366
35
4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
128906201--128906371
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
128911781--128911878
48
2.0
49
92
2
162
37
9
18
34
1.83
128915289--128915370
26
3.2
26
98
0
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36
26
6
30
1.81
128922265--128922372
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4.2
26
96
0
198
36
25
6
31
1.82
128934653--128934733
21
3.7
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62
61
1
3
33
1.21
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2.0
21
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55
65
0
2
32
1.06
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2.4
44
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131
30
21
14
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1.93
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2.6
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123
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1.88
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19
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2
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0
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10
40
1.77
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20
2.0
20
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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2.4
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13
33
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438