Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   

This is table  330  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103472300--103472328
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3
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0
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0
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0
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8
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0
9
0
90
0.45
103472330--103472361
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3.0
11
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4
57
0
9
0
90
0.45
103475517--103475545
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2.7
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5
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0
6
0
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0.36
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49
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2.9
212
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0
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2.1
33
100
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17
21
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38
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20
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2.2
40
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25
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23
1.99
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3.0
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1.98
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5.7
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271
25
26
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1.99
103525409--103525635
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119
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305
25
26
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2.5
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29
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29
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4.8
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6
234
35
16
24
22
1.95
103561085--103561217
49
2.6
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80
4
135
36
16
25
21
1.94
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1.9
16
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0
53
41
0
22
35
1.54
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43
2.9
43
89
3
178
25
18
29
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103566705--103566844
43
3.5
39
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5
163
24
21
29
25
1.99
103566707--103566844
40
3.4
40
84
6
127
24
21
28
25
1.99
103568219--103568484
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2.0
132
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0
523
20
28
21
28
1.98
103578303--103578520
40
5.5
40
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2
316
24
28
23
22
1.99
103581083--103581122
16
2.5
16
100
0
80
27
20
22
30
1.98
103583025--103583073
24
2.0
24
100
0
98
32
4
18
44
1.68
103588121--103588210
34
2.5
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75
10
94
26
27
20
25
1.99
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33
2.0
33
100
0
132
45
12
12
30
1.78
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16
2.0
16
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0
55
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12
21
25
1.88
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48
3.7
48
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6
171
23
31
17
27
1.97
103592962--103593227
48
5.7
47
75
10
158
24
30
18
27
1.97
103593015--103593319
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6.5
46
71
14
144
23
29
18
28
1.98
103600902--103601018
47
2.5
46
84
12
150
27
29
9
33
1.88
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4
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0
50
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0
0
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0.80
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20
2.0
20
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55
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29
1.74
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24
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24
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25
20
25
29
1.99
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18
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5
200
39
11
12
36
1.79
103605637--103605778
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4.0
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239
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17
3.9
17
73
17
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33
1
0
64
1.03
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1.9
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0
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0
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0
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7
0.73
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5.7
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80
16
62
83
0
12
4
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103611928--103611989
13
4.7
13
82
7
63
83
0
12
3
0.75
103611917--103611989
22
3.2
21
81
14
83
83
0
12
4
0.78
103612864--103613039
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4.0
43
75
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167
32
15
23
28
1.95
103612865--103613025
88
1.8
87
81
4
198
31
16
23
29
1.96
103613025--103613388
119
3.1
119
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33
17
18
29
1.95
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2.9
83
90
0
362
34
20
18
26
1.96
103613963--103614095
18
7.5
18
88
5
200
39
11
12
36
1.79
103613954--103614095
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4.0
35
95
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239
38
10
13
37
1.79
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35
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0
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1.04
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4
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2.0
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2.1
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10
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3
40
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103646705--103646766
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2.7
22
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22
27
1.88
103646705--103646775
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3.0
25
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9
39
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29
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2.1
16
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10
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14
5
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70
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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0
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20
0
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103655912--103655953
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0
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1.75
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20
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1.52
103659785--103659862
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0
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0
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2.00
103671213--103671397
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2.00
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2.0
24
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0
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4
2
53
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
19
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7
17
38
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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20
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0
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35
11
21
32
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433   434   435   436   437   438