Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  292  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91514964--91515011
16
3.1
16
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11
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29
1.37
91514964--91515004
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58
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0
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1.31
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2.0
15
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0
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16
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1.18
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5.2
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26
22
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23
2.00
91521909--91522114
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2.6
79
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2
245
26
22
27
23
2.00
91529889--91530096
40
5.2
40
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2
220
25
23
26
24
2.00
91537131--91537481
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46
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161
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20
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22
1.99
91537131--91537481
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20
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1.99
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2.8
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214
29
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1.97
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2.8
53
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4
214
29
27
16
25
1.97
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1.9
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0
214
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160
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0
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1.96
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1.9
71
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0
214
30
16
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1.96
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1.8
85
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2
253
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32
1.96
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254
31
17
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1.96
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0
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2.9
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3
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28
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15
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17
2.0
17
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6
0
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2.0
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19
2.1
19
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9
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35
2
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2.3
18
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24
14
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1.95
91588572--91588623
14
3.6
14
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10
50
48
1
1
48
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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0
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2
0
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1.10
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103
2.0
103
96
0
374
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7
33
1.79
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15
2.2
16
95
5
63
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0
34
1.47
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0
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2.8
14
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50
2
0
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1.14
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11
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1.70
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21
2.1
21
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34
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54
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2.0
29
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0
89
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1.92
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2.0
15
93
0
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0
10
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1.36
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2.3
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38
0
11
50
1.38
91639460--91639506
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4
2
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1.27
91647465--91647544
15
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15
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7
74
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1.62
91647476--91647553
15
5.2
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17
63
55
15
19
10
1.68
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46
3.5
46
77
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168
28
28
20
22
1.99
91650471--91650640
93
1.8
93
88
0
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29
27
20
22
1.98
91656155--91656292
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2.9
48
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2
170
24
29
17
28
1.97
91661644--91661793
41
3.7
41
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1
221
28
28
22
20
1.99
91667490--91667559
28
2.5
28
88
9
99
31
27
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91675279--91675348
28
2.5
28
88
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99
31
27
14
27
1.95
91680543--91680732
81
2.3
81
88
1
265
28
26
22
21
1.99
91680543--91680732
40
4.7
41
85
2
267
28
26
22
21
1.99
91683765--91683846
40
2.0
40
97
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155
40
20
7
31
1.80
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42
2.7
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24
32
24
19
1.98
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14
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16
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85
2
12
0
0.70
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40
6.2
39
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252
23
22
28
26
1.99
91687963--91688145
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2.3
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22
27
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2.00
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11
235
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25
1.99
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2
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5
60
50
2
0
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1
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1
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0.87
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11
7.2
11
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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15
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438