Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  362  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113074146--113074316
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3.6
48
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6
177
32
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26
23
1.97
113074101--113074315
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4.6
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26
24
1.97
113074143--113074315
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1.8
94
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2
249
31
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23
1.97
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2.3
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0
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16
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2.0
56
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2.1
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0
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0
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100
0
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1
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0
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0
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10
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1.87
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0
249
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21
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29
1.99
113130857--113131002
23
6.2
24
86
4
217
26
21
22
29
1.99
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3.5
20
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0
115
32
19
11
36
1.87
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16
55
30
18
12
38
1.88
113131155--113131202
25
1.9
25
86
0
69
27
12
25
35
1.92
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27
2.1
27
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6
69
21
21
23
33
1.97
113132481--113132532
27
1.9
27
88
7
79
36
11
11
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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18
36
1.82
113132608--113132777
81
2.1
81
84
2
216
42
10
17
28
1.83
113132634--113132865
27
8.6
27
87
3
279
42
9
20
28
1.82
113132878--113132967
27
3.3
27
82
3
110
33
10
17
38
1.83
113132878--113132982
27
3.9
27
76
9
81
35
9
17
38
1.82
113154465--113154726
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6.6
40
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1
411
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26
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23
1.99
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39
3.9
39
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243
23
21
32
22
1.98
113159463--113159612
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1.9
77
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2
248
24
22
32
22
1.98
113159468--113159642
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4.5
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23
23
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1.98
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2.4
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0
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24
22
31
21
1.98
113167569--113167757
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4.9
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3
319
24
22
31
21
1.98
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172
2.0
172
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0
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4.2
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17
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2.4
25
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35
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20
20
1.96
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93
1.9
93
85
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244
28
28
17
25
1.97
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93
2.4
93
81
8
236
29
28
17
24
1.97
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2.3
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34
0
17
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6.9
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363
26
18
24
29
1.98
113189206--113189549
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3.4
100
81
5
329
26
18
24
29
1.98
113189204--113189549
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2.3
151
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577
26
18
24
29
1.98
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2.0
16
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46
0
18
34
1.49
113195688--113195862
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3.6
49
79
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196
22
28
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113195637--113195862
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269
23
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26
1.99
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2.0
31
96
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22
4
32
1.75
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25
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61
29
23
21
25
1.99
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1.9
29
82
6
71
39
3
5
51
1.41
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1.9
61
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175
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4
50
1.38
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0
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50
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0
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31
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181
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20
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0
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20
32
1.86
113261195--113261249
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16
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38
10
20
30
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23
92
4
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29
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113261299--113261465
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246
29
22
22
26
1.99
113261656--113261750
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3.1
31
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0
181
38
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23
1.92
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0
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0
0
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1.99
113288181--113288396
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1.82
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28
1.82
113290195--113290301
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2.0
54
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137
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10
20
37
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.82
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0
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1.54
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12
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4
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58
8
1
30
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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39
4
0
55
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          433   434   435   436   437   438