Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  291  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91211365--91211425
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20
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0
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1.9
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12.7
27
87
3
359
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9
22
27
1.84
91212749--91213088
107
3.2
106
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2
457
40
9
22
27
1.84
91212749--91213088
81
4.2
81
86
1
461
40
9
22
27
1.84
91212749--91213088
54
6.3
54
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443
40
9
22
27
1.84
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2.1
31
90
0
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15
35
1.94
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24
6.0
24
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21
22
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1.99
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2.0
71
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227
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21
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30
1.99
91216319--91216379
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
91216421--91216468
25
1.9
25
91
0
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25
14
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27
12.7
27
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361
40
9
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4.2
81
85
3
447
40
9
23
27
1.85
91217706--91218047
54
6.3
54
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1
445
40
9
23
27
1.85
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20
21
1.98
91220682--91220814
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148
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22
22
21
1.98
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2.5
10
100
0
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0
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12
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0
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2
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24
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2.00
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2.2
40
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112
23
24
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23
1.99
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2.3
81
84
7
232
23
22
27
26
1.99
91246926--91247109
40
4.6
40
82
9
216
23
22
28
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91246926--91247132
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2.6
79
79
12
228
24
21
27
26
1.99
91256319--91256432
57
2.0
57
96
0
210
30
16
26
26
1.97
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6
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0
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16
2
2
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0.98
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2.0
20
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39
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20
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1.79
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4.1
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0
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3
0
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1.12
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20
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0
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15
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1
0
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1.10
91288476--91288512
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12
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0
0
40
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0
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0
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0
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1.51
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2.0
19
89
0
58
63
5
0
31
1.17
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28
2.9
28
75
15
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1
32
1.21
91289041--91289109
34
2.0
34
83
10
88
66
4
0
28
1.10
91289213--91289287
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2.6
30
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93
61
6
0
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1.22
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11
3.4
11
88
7
56
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91289320--91289374
21
2.7
21
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5
0
41
1.24
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20
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58
5
0
35
1.26
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10
7.5
10
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8
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27
1
6
64
1.26
91289975--91290073
41
2.4
43
75
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1
9
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25
0
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1.23
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2.2
26
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12
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19
24
7
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1.73
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3.5
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4
174
23
26
24
24
2.00
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4.0
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221
27
27
21
24
1.99
91302539--91302695
79
2.0
79
86
5
219
27
27
21
24
1.99
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2.1
19
100
0
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0
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150
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721
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20
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0
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8
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.96
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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29
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91497138--91497500
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24
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41
10
1
46
1.45

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438