Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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176
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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0
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1.01
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19
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20
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16
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0
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34
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0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13092597--13092621
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25
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0
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1.70
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6
40
1.64
13114916--13115028
20
5.7
20
76
0
82
44
10
5
39
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13115018--13115061
21
2.2
20
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4
52
40
13
0
45
1.44
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22
2.1
21
83
8
63
38
25
4
31
1.76
13120201--13120434
43
5.5
43
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3
283
30
25
17
26
1.97
13120192--13120434
86
2.8
85
84
4
328
31
25
16
26
1.97
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23
26
18
31
1.98
13138313--13138537
98
2.3
98
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280
22
26
20
31
1.98
13139236--13139286
20
2.7
18
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14
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37
21
0
41
1.54
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23
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1.93
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3.5
30
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30
13
26
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1.94
13152986--13153086
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29
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26
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1.94
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28
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127
30
13
26
28
1.94
13160915--13161015
29
3.5
29
81
9
116
30
13
26
28
1.94
13162805--13162901
40
2.4
40
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0
131
29
19
22
27
1.98
13162912--13163011
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2.6
38
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4
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28
22
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35
1.94
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2.0
88
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1.64
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2
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0
0
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1.45
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2.0
22
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0
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1.63
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11
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0
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0
63
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33
25
0
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13190589--13190623
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12
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0
1.54
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2.5
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1.20
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1.98
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2.3
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255
24
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19
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1.98
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230
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1.97
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24
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0
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0
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0
0
100
0.00
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1.20
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1.27
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19
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0
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0
0
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20
1.97
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11.1
44
67
8
268
34
20
24
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13263019--13263500
86
5.6
86
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2
662
34
20
24
19
1.96
13263019--13263500
172
2.8
172
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2
734
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20
24
19
1.96
13264502--13264576
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2.0
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0
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1
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0
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0
0
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3.1
11
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4
52
65
0
0
34
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438