Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  431  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132856943--132856984
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2.0
21
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0
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0
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2.7
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0
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0
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17
26
11
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132865816--132865871
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0
0
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100
0
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11
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1
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132867355--132867485
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68
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0
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2.3
168
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0
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24
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100
0
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14
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1.68
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28
19
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2.7
20
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0
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9
33
37
18
1.83
132891991--132892024
2
17.5
2
87
6
52
52
2
0
44
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132891981--132892034
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57
1
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4.4
9
93
0
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65
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2
25
1.32
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3
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131
60
2
4
32
1.29
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16
2.1
16
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50
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0
0
33
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20
16
31
1.95
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1.9
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409
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17
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1.95
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443
32
19
16
31
1.93
132895073--132895486
72
5.7
72
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4
555
33
17
16
32
1.92
132894977--132895486
149
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143
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19
16
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1.93
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57
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17
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1.90
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167
32
11
23
32
1.90
132908646--132908716
36
2.0
35
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2
106
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30
1.92
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0
50
52
0
0
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1.00
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2.0
21
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9
50
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2
2
40
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3
20.7
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81
12
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1
0
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1.03
132910847--132911120
3
89.7
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117
58
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5
32
1.38
132911145--132911177
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2.1
16
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5
50
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0
0
33
0.92
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24
12
1.92
132918480--132918526
22
2.1
23
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69
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70
1.22
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488
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31
4
26
1.76
132922522--132922759
114
2.1
113
85
2
327
40
26
4
28
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132922634--132922917
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28
4
27
1.76
132922695--132922917
82
2.8
81
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4
281
39
30
4
26
1.77
132922879--132922948
33
2.2
32
87
7
97
42
24
4
28
1.73
132922797--132923030
113
2.1
114
86
3
330
39
30
4
25
1.75
132922910--132923116
80
2.6
80
86
3
281
37
30
5
26
1.79
132922717--132923222
193
2.6
193
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3
736
38
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5
26
1.78
132922991--132923310
112
2.9
114
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4
427
37
30
5
27
1.79
132923185--132923253
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2.2
31
92
5
111
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1.73
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0
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0
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0
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1.20
132970330--132970797
23
20.4
22
66
24
101
34
4
5
55
1.45
132970311--132970424
23
4.9
24
73
20
91
33
5
4
57
1.41
132970580--132970670
25
3.7
25
79
5
96
34
5
6
53
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
132970732--132970771
21
2.0
21
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5
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35
10
2
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21
2.0
21
90
0
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17
17
51
14
1.77
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2.0
45
95
0
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13
31
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16
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5
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0
27
1.30
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21
2.3
21
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10
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6
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14
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1.40
132987940--132987985
21
2.2
21
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58
6
13
13
67
1.41
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21
3.2
21
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19
59
57
7
5
29
1.50
132988317--132988403
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2.0
43
100
0
174
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6
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61
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1.69
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16
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0
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12
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1.73
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2.0
45
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0
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1.83
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1.9
42
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128
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1.81
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2
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0
0
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1.00
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0
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2.0
22
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1.86
133013295--133013464
9
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9
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36
1
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2
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1.58
133017441--133017529
46
2.0
45
91
4
144
28
25
13
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.7
24
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20
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23
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1.28
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0
0
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1.28
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2.0
24
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1.59
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0
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0
0
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0
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200
28
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20
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1.98
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93
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20
1.98
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200
28
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20
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1.98
133051897--133052068
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93
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299
28
29
20
20
1.98
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2.0
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28
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0
0
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0
0
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0
0
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25
3.2
23
78
14
75
69
0
0
30
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133075156--133075230
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37
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0
150
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1.55
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28
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20
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1.95
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2.0
121
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17
19
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1.94
133090343--133090694
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460
30
17
19
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1.94
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95
1.8
95
86
2
249
27
20
19
31
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438