Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  437  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134906744--134906910
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4.6
35
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7
192
33
23
10
31
1.89
134914238--134914405
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
134914233--134914405
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
134917674--134917758
41
2.1
41
97
0
161
27
7
16
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1.71
134917689--134917753
19
3.3
19
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62
27
6
13
52
1.64
134917687--134917752
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3.1
22
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27
52
28
6
13
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2.0
103
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1
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26
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17
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1.9
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1.9
20
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5
0
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100
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16
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1.9
263
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19
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0
0
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190
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11
22
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1.84
134963661--134963974
158
2.0
158
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2
443
23
12
20
44
1.85
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2.8
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127
23
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10
53
1.69
134976011--134976043
14
2.2
16
89
10
52
6
21
3
69
1.24
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13
2.1
13
100
0
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29
18
22
29
1.97
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9
9.6
9
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124
42
21
11
24
1.85
134979512--134979558
14
3.3
14
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11
60
21
2
0
76
0.89
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6.5
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13
57
19
2
0
78
0.86
134979518--134979568
20
2.5
20
93
3
84
21
3
0
74
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134981220--134981332
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2.1
54
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203
23
3
15
57
1.53
134984589--134984618
7
4.1
7
91
8
51
26
0
13
60
1.34
134984589--134984618
15
2.1
15
93
6
53
26
0
13
60
1.34
134987349--134987383
16
2.2
16
94
0
61
40
11
5
42
1.65
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2
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100
0
90
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0
0
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1.00
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4.0
46
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100
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0
0
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1.00
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3.5
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412
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18
30
1.94
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30
2.2
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13
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31
2.7
31
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1
123
36
12
9
42
1.75
135021880--135021923
15
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25
9
11
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1.65
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2.1
16
100
0
66
36
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1.75
135039525--135039553
2
14.5
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100
0
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48
0
0
51
1.00
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2
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35
13
22
27
1.92
135041220--135041353
46
3.0
45
82
4
153
35
14
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26
1.93
135043368--135043444
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2.5
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51
10
2
35
1.50
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2.0
23
82
0
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50
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2
43
1.34
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25
1.9
25
91
0
78
37
8
16
37
1.79
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25
2.2
25
81
3
69
38
7
15
38
1.75
135074826--135074855
13
2.3
13
94
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51
53
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30
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0
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0
0
48
1.00
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10.0
4
83
0
53
27
5
22
45
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
135095957--135096000
15
3.1
15
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9
58
25
45
0
29
1.54
135098532--135098573
21
2.0
21
100
0
84
38
19
4
38
1.73
135106129--135106187
30
2.0
29
87
6
84
37
8
10
44
1.69
135113881--135114142
109
2.4
109
94
0
454
37
8
14
40
1.75
135114426--135114453
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
135116140--135116212
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4.5
16
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11
69
39
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24
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1.64
135116140--135116220
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2.5
34
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2
23
32
1.67
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2.1
36
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9
91
50
2
2
44
1.30
135116389--135116466
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2.2
36
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92
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2
2
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1.91
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2.0
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28
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2.5
51
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2
215
24
23
17
34
1.95
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2
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0
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0
0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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1.48
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0
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1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438