Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11605729--11605956
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46
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1
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1.18
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39
2.3
38
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1.20
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3.3
19
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5
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1.12
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21
1.9
21
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2.7
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21
20
29
28
1.98
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0
0
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2.0
20
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10
53
43
30
7
17
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
0
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1.00
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27
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2
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29
1.35
11664117--11664216
26
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26
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2
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4
33
1.35
11667075--11667134
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2.0
29
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3
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1
1
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0
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20
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2
0
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1.13
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2.0
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1
1
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1.22
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0
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4
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2.1
22
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22
6
4
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53
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9
0
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11678381--11678421
21
2.0
21
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0
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39
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2
53
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11678386--11678456
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83
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2
1
59
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11678410--11678451
20
2.0
21
90
4
68
42
0
2
54
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11683437--11683674
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28
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22
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19
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29
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3
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3
82
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29
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1.40
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2.2
27
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77
26
5
8
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1.47
11683919--11683979
21
2.9
21
75
0
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34
0
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2.0
14
100
0
56
21
14
28
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11687881--11687964
26
3.2
26
91
0
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4
25
36
1.77
11689442--11689493
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2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
11694875--11694958
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
11696429--11696480
25
2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
11701327--11701365
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1.9
20
89
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60
64
10
2
23
1.37
11701409--11701456
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1.9
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16
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58
8
0
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1.28
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13.3
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0
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0
0
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18
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1
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25
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1.98
11713159--11713187
12
2.4
12
100
0
58
10
24
51
13
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11718049--11718155
26
4.2
25
89
5
151
33
8
23
34
1.85
11718049--11718155
52
2.1
51
91
1
169
33
8
23
34
1.85
11719633--11719681
25
2.0
25
84
8
64
38
20
16
24
1.92
11719927--11720212
136
2.1
137
96
0
520
25
18
24
31
1.98
11723077--11723155
31
2.5
30
82
15
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24
2
2
70
1.11
11723101--11723161
6
9.8
6
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19
1
3
75
1.03
11723161--11723355
86
2.3
86
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1
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25
21
27
26
1.99
11723161--11723355
43
4.5
43
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0
237
25
21
27
26
1.99
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2.7
23
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3
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5
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2
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0
0
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1
1
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27
5.0
28
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24
19
1.96
11732846--11732953
26
4.2
26
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0
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34
1.82
11732846--11732953
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2.1
52
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0
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1.82
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26
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0
193
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11739560--11739608
16
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2
2
51
1.24
11741967--11742040
37
2.0
37
100
0
148
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13
2.8
13
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0
2
34
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11746022--11746074
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2.0
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37
1.92
11747547--11747665
22
5.2
24
75
23
100
36
24
4
35
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11747594--11747654
21
3.0
21
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22
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1.79
11751302--11751479
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19
20
29
29
1.97
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22
2.0
23
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0
1
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0
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0
0
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0
0
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0
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1.98
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87
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26
1.98
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1.96
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54
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1.96
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0
122
32
0
16
50
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11795030--11795066
18
2.1
18
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0
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1.83
11795668--11795736
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0
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0
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0
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1.97
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18
2.1
18
90
9
60
26
21
21
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438