Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  358  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111874126--111874202
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7.9
9
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55
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22
35
1.85
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0
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20
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48
2.5
48
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161
27
21
23
27
1.99
111874260--111874378
23
5.0
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163
27
21
23
27
1.99
111874568--111874648
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2.6
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34
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22
1.95
111881890--111881937
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1.9
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86
0
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25
16
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1.96
111881976--111882052
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16
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7
22
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1.83
111882005--111882047
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16
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1.85
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20
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20
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1.9
48
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4
161
25
21
23
29
1.99
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23
4.4
24
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7
160
28
20
23
27
1.99
111882423--111882490
31
2.2
32
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2
102
38
14
25
22
1.92
111884418--111884558
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3.4
41
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0
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20
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30
1.98
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18
100
0
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38
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0
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20
20
1.97
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6.7
27
88
0
254
30
22
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39
1.81
111892703--111892883
81
2.2
81
90
0
299
30
22
7
39
1.81
111892659--111893027
27
13.7
27
83
3
226
36
22
7
33
1.83
111892727--111892912
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2.3
81
88
1
266
32
22
7
38
1.82
111892754--111893008
81
3.1
81
81
3
255
35
21
7
35
1.83
111892876--111893056
81
2.2
80
86
2
238
39
21
10
28
1.86
111893015--111893261
27
9.1
27
89
0
341
34
17
21
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111893729--111893811
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2.7
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3
132
30
15
24
30
1.96
111910870--111911504
97
6.5
97
95
1
1123
33
12
26
28
1.92
111911573--111911659
37
2.3
36
94
5
147
20
19
33
26
1.97
111913531--111913584
26
2.1
26
96
0
99
35
24
11
29
1.90
111921056--111921118
31
2.1
31
87
3
92
23
25
14
36
1.93
111921310--111921452
24
6.0
24
91
4
209
26
22
22
28
1.99
111921310--111921451
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
111921309--111921452
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
111921502--111921562
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
111921604--111921651
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
111925115--111925165
21
2.5
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17
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43
1
1
52
1.23
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3.5
40
82
1
124
27
24
26
21
1.99
111928602--111928731
40
3.3
39
78
11
147
23
24
26
24
2.00
111931451--111931515
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2.2
28
79
15
69
26
18
4
50
1.66
111932354--111932412
10
6.0
10
71
16
52
35
1
1
61
1.16
111932363--111932427
18
3.5
18
76
14
69
30
3
3
63
1.25
111932343--111932422
38
2.1
37
93
2
133
33
2
1
62
1.16
111933433--111933497
30
2.2
30
82
0
76
32
43
13
10
1.79
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125
2.0
126
87
0
362
28
17
17
36
1.92
111937113--111937236
30
3.8
32
78
17
105
43
17
0
37
1.55
111937159--111937288
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162
42
19
0
37
1.57
111937142--111937289
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2.3
65
90
5
246
42
20
0
36
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111937114--111937302
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5.7
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141
43
17
1
37
1.57
111937819--111937844
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3.2
8
100
0
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0
0
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2.1
22
84
0
58
31
2
2
63
1.18
111938069--111938111
22
2.0
22
90
0
68
30
2
0
67
1.03
111939602--111939631
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3.0
10
90
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0
10
16
1.09
111950082--111950153
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3.0
23
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13
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52
18
1
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1.9
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100
0
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0
0
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1.54
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2.0
20
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22
0
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1.54
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16
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1.8
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22
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101
54
4
5
36
1.41
111980158--111980228
19
4.1
16
77
16
52
56
1
4
38
1.28
111980169--111980228
19
3.4
17
76
17
59
58
0
3
38
1.15
111980199--111980242
21
2.2
20
83
4
52
65
4
0
29
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111980429--111980467
3
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3
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0
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64
0
2
33
1.08
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23
2.5
22
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6
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59
7
1
31
1.36
111980567--111980637
3
23.3
3
74
8
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61
5
1
30
1.27
111982114--111982783
89
7.7
87
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35
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17
27
1.94
111982125--111982783
88
7.6
86
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15
407
35
19
17
27
1.94
111982681--111982709
14
2.1
14
100
0
58
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6
13
13
1.45
111982259--111983074
254
3.3
254
85
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1006
32
21
18
27
1.96
111982839--111982873
14
2.5
14
90
0
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54
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22
14
1.67
111982764--111982927
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89
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1.97
111982604--111983020
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163
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21
18
26
1.96
111982869--111983075
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18
28
1.98
111982869--111983074
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2.8
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5
278
28
25
17
28
1.98
111995141--111995388
120
2.1
120
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0
478
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25
1.65
111995794--111995858
2
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111995759--111995858
49
2.1
47
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17
118
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2
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1.33
111995759--111995873
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4.9
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1
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111995841--111995884
21
2.2
20
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4
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4
0
29
1.12
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100
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0
0
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2.5
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1
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1.36
111996203--111996273
3
23.3
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8
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1
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1.27
111996742--111996776
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29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112000935--112000962
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13
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0
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2.1
37
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0
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0
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0
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0
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210
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0
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1.92
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0
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0
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1.93
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1.91
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3.5
18
69
21
55
31
26
13
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
20
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0
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2
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1.50
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2.1
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0
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1.51
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200
26
18
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26
1.98
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28
1.97
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0
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2.00
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1.98
112074537--112074730
49
3.9
49
76
6
167
26
19
26
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438