Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  395  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123091212--123091269
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22
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0
1
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1.03
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39
1.28
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2.7
21
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0
85
25
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2.0
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28
20
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2.3
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0
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3.1
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28
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17
28
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1.96
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2.3
71
100
0
328
35
17
28
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2.5
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0
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2.1
108
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15
15
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2.0
69
98
0
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25
10
19
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16
2.6
16
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10
52
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2
2
30
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123149579--123149640
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12
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0
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0
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1.9
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42
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26
2.2
26
83
0
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41
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5
44
1.58
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2.4
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2.1
21
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0
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139
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2.6
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1.89
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2.0
42
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0
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26
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19
2.4
19
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20.5
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0
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0
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2
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40
20
5
34
1.75
123189435--123189522
23
3.9
23
71
21
78
32
18
23
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123189731--123189766
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138
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19
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2.1
18
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0
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1.55
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100
0
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0
0
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1.00
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2.0
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78
27
18
0
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1.44
123203536--123203658
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3.4
36
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10
106
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4
9
43
1.59
123203518--123203654
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1.9
73
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213
40
5
9
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1.61
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3.2
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14
23
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0
0
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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34
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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0
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0
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438