Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  55  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2.3
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14202303--14202670
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1.92
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11
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3
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35
1
1
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2.5
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1
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1.13
14204386--14204453
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4.8
13
79
13
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1
1
61
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14205183--14205252
21
3.2
20
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1.52
14217580--14217605
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13
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99
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26
23
27
2.00
14249974--14250123
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1.9
80
83
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198
22
26
24
27
1.99
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40
4.2
40
80
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176
23
26
23
26
2.00
14262105--14262254
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2.1
13
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0
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14274272--14274323
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2.2
24
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13
100
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1.58
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1.96
14295661--14295804
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57
80
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163
31
23
18
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1.98
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0
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34
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0
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2
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6
0
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20
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3
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33
7
1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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1.92
14350970--14351178
88
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89
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28
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14352681--14352722
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177
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2.2
353
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24
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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37
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438