Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  83  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22602434--22602520
40
2.2
40
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4
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24
25
20
29
1.99
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43
2.7
42
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140
28
15
24
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1.96
22605074--22605103
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0
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2.0
54
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0
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1.94
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29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
22614694--22614817
44
2.8
45
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4
173
36
16
20
26
1.94
22615963--22616149
40
4.7
40
89
0
284
33
27
18
19
1.96
22623427--22623457
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2.4
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24
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4
230
26
21
22
29
1.99
22627766--22627932
47
3.5
48
87
4
232
26
20
22
29
1.99
22627767--22627933
71
2.3
71
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3
255
26
20
23
29
1.99
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25
2.0
24
83
4
60
25
18
25
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1.98
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27
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335
39
8
23
28
1.84
22629332--22629590
81
3.2
81
87
3
378
39
8
23
28
1.84
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2.0
14
100
0
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28
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1.79
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2.0
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25
1.92
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40
4.2
40
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2
176
23
26
22
26
2.00
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17
2.5
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22
53
34
23
17
23
1.96
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40
4.2
41
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5
164
24
26
22
26
2.00
22665104--22665149
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
22669416--22669459
22
2.0
22
82
8
54
59
4
0
36
1.18
22673012--22673083
35
2.1
35
94
0
126
41
9
11
37
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22677611--22677638
2
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2
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0
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0
0
50
1.00
22683105--22683206
52
2.0
52
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3
170
37
13
7
41
1.74
22683912--22683956
2
22.5
2
86
0
54
42
0
6
51
1.28
22685614--22685639
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
22694015--22694140
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3.7
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18
100
53
3
2
41
1.30
22694015--22694157
68
2.0
72
82
7
179
53
2
2
41
1.27
22694503--22694554
16
3.2
15
78
19
52
48
15
0
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1.45
22701355--22701408
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26
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0
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16
25
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1.92
22701456--22701629
46
3.8
45
76
11
147
22
28
19
29
1.98
22715218--22715312
44
2.2
44
85
7
133
31
25
18
24
1.98
22715159--22715312
42
3.6
42
77
9
134
31
25
17
24
1.97
22719864--22719895
15
2.0
17
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11
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31
6
28
34
1.82
22721948--22722152
40
5.1
40
74
11
168
26
14
26
33
1.94
22725657--22725933
48
5.7
48
74
11
235
27
26
18
27
1.98
22725641--22725937
98
3.1
98
88
3
424
26
26
19
27
1.99
22730620--22730803
40
4.6
40
81
2
172
28
22
26
22
1.99
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2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99
22738628--22738811
40
4.6
40
81
2
172
28
22
26
22
1.99
22738668--22738856
80
2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99
22740703--22740727
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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166
33
29
15
22
1.94
22744272--22744427
56
2.8
55
82
3
188
19
19
33
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22748638--22748752
43
2.7
42
71
10
97
26
17
26
28
1.98
22752024--22752186
39
4.2
39
90
0
254
23
32
20
23
1.98
22757148--22757300
40
3.8
40
78
9
143
22
23
28
25
2.00
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29
2.1
29
87
3
84
45
3
23
27
1.68
22766942--22767000
29
2.1
28
81
9
66
49
1
22
27
1.59
22767540--22767667
47
2.7
47
84
7
161
21
14
28
35
1.92
22777557--22777655
29
3.4
29
76
6
85
24
30
17
28
1.97
22783504--22783602
42
2.3
42
79
5
110
28
23
20
28
1.99
22783485--22783642
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1.9
85
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5
203
27
27
19
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1.99
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71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
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3
258
20
28
17
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1.95
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12
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16
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1.96
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29
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6
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26
27
20
25
1.99
22828742--22829024
48
5.9
47
80
2
278
27
17
29
25
1.97
22828757--22829030
96
2.8
97
83
2
347
28
17
28
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22828741--22829024
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2.0
144
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27
17
29
25
1.97
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2.4
21
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0
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18
20
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0
100
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16
27
28
1.97
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6
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0
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1.89
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19
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20.5
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2.3
272
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19
18
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1.95
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19
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27
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20
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1
2
28
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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1.33
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22908419--22908838
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29
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29
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19
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1.97
22924775--22924907
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10
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26
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25
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2.0
22
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1.9
38
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5
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24
2
8
64
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22943494--22943531
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19
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0
0
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2
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1.21
22944464--22944540
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2.8
28
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2
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1.21
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2.0
21
85
9
57
51
4
7
36
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          433   434   435   436   437   438