Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  266  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82695173--82695491
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1.75
82696006--82696119
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15.6
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73
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0
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43
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82701105--82701269
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2.1
19
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0
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2
58
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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66
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17
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23
28
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1.99
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2.0
22
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247
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30
23
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82741155--82741280
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23
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2.00
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23
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24
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24
1.98
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5
318
24
29
18
26
1.98
82781236--82781505
49
5.7
48
77
14
251
23
30
19
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82781235--82781504
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10
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30
19
26
1.98
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10
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25
20
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23
1.98
82784548--82784834
158
1.8
158
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4
400
26
17
29
26
1.98
82784684--82784892
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2.2
96
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3
278
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20
30
23
1.98
82785079--82785194
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58
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0
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1.97
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48
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201
26
18
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25
1.98
82792416--82792668
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137
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1.98
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40
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23
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2.00
82815612--82815866
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23
27
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2.00
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39
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22
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2.00
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117
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1.99
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2.4
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1.98
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4.1
47
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1.91
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23
1.94
82832162--82832354
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2.1
94
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1
271
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10
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26
1.91
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23
1.92
82832325--82832505
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1.9
96
92
5
307
35
7
26
30
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82832324--82832505
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48
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1.83
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37
2.9
37
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0
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1.98
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1.99
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1.98
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28
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1.98
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29
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1.98
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1.97
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0
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4.2
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43
20
6
30
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82882946--82883124
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54
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1.76
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1.78
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19
1.95
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3.4
49
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0
278
28
9
33
29
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438