Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  132  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39287247--39287302
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0
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29
2.0
28
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3
80
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2.6
104
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1.98
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0
0
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0.99
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0
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50
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23
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28
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3
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28
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30
1.85
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28
3.2
27
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4
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18
23
24
33
1.97
39346781--39346870
27
3.2
28
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103
18
23
24
33
1.97
39346781--39346895
55
2.1
56
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8
137
18
23
22
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1.95
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19
2.1
19
85
0
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15
5
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21
2.0
22
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2
196
24
31
18
25
1.98
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23
79
10
137
25
20
19
34
1.96
39368455--39368606
46
3.3
46
82
6
157
26
19
17
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39368501--39368615
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14
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28
21
16
33
1.95
39369311--39369358
20
2.4
21
82
10
64
68
6
2
22
1.23
39372119--39372159
22
1.9
21
85
5
55
53
0
2
43
1.13
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13
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0
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42
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57
0
0.98
39374637--39374697
18
3.4
18
90
0
86
42
0
57
0
0.98
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19
2.5
20
93
6
82
22
4
4
68
1.24
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40
2.2
39
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6
100
18
2
31
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1.62
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77
16
0
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45
0
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1.42
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22
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25
1
28
1.62
39375919--39376019
7
14.1
7
76
4
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41
37
0
19
1.59
39375989--39376032
21
2.1
21
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45
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1.49
39376229--39376340
54
2.1
54
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127
18
0
27
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41
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199
18
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23
35
1.96
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41
4.0
40
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19
22
22
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1.96
39388750--39388829
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2.2
36
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10
23
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1.87
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27
3.7
27
75
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30
9
22
39
1.84
39395213--39395289
27
2.9
27
82
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100
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7
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1.78
39395187--39395289
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1.9
54
80
4
118
31
9
18
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39396241--39396506
48
5.6
48
73
13
196
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19
25
29
1.98
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2.1
27
86
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23
32
21
23
1.98
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2.1
14
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51
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10
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2.1
31
91
0
105
50
22
10
16
1.76
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27
2.8
21
73
24
65
4
43
18
32
1.71
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2.1
14
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51
55
10
0
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1.34
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1.99
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25
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1.99
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79
2.6
80
78
6
190
24
30
23
22
1.99
39416422--39416529
40
2.7
40
86
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135
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30
25
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1.99
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22
20
32
24
1.98
39417751--39417901
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1.9
79
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2
252
23
21
31
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1.98
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233
22
21
31
23
1.98
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118
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3
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50
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0
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4
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Period
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Copy
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Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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188
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28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
137
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0
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13
13
35
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39503980--39504058
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30
1.96
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1.97
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1.97
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33
21
1.97
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139
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13
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54
4
40
0
54
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438