Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  76  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20396328--20396362
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18
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0
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33
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0
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1.95
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29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
20414132--20414166
18
1.9
18
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2.00
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3.1
14
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58
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1.42
20443352--20443390
13
2.9
13
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10
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28
1.44
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5.6
40
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28
26
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1.99
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2.8
80
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290
28
27
20
23
1.99
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14
3.1
14
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52
58
9
2
30
1.42
20451468--20451506
13
2.9
13
84
3
51
58
10
2
28
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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35
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26
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26
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35
1.74
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2
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0
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21
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2.5
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2.5
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1
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2.0
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17
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21
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2.4
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0
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20
18
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1.96
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2.1
44
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24
18
23
1.96
20521502--20521669
25
6.6
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73
20
131
33
25
14
26
1.94
20521503--20521643
50
2.8
50
89
1
201
34
25
14
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1.94
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0
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18
28
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1.98
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1.8
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221
29
18
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1.98
20551017--20551060
14
2.9
15
86
6
54
11
15
15
56
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20551209--20551261
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0
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1.00
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2.6
255
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10
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23
2.0
23
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40
13
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37
1.76
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1.9
32
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2.0
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2.2
24
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27
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2
266
35
19
20
25
1.96
20579467--20579687
54
4.1
54
87
2
293
35
19
20
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20579475--20579689
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26
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8
245
35
19
20
24
1.96
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3.0
22
80
8
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20
23
23
33
1.97
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27
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6
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1
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20
17
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27
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0
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1.82
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0
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7
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1.80
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1.84
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1.83
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22
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0
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0
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1.83
20593256--20593781
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80
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525
32
9
18
39
1.83
20593230--20593780
27
20.6
27
82
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501
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18
39
1.84
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22
2.0
21
90
4
68
25
2
18
53
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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1.95
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1.96
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1
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1.95
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0
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0
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0
0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20674364--20674447
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25
1.98
20675345--20675519
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0
0
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0.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438