Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   

This is table  49  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12313379--12313601
76
2.8
78
88
6
308
24
21
27
26
1.99
12313379--12313601
39
5.7
39
88
5
299
24
21
27
26
1.99
12313379--12313601
115
1.9
119
87
5
330
24
21
27
26
1.99
12319747--12319974
40
5.7
40
88
1
314
23
21
28
25
1.99
12319747--12319995
120
2.1
120
87
2
349
23
21
28
26
1.99
12323100--12323521
89
4.8
89
77
6
378
32
18
20
27
1.97
12323100--12323524
44
9.7
44
76
6
342
32
18
21
27
1.97
12323102--12323524
133
3.2
131
77
8
414
32
18
21
27
1.97
12326126--12326203
33
2.3
33
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2
138
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11
6
41
1.67
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229
1.9
229
98
0
856
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14
16
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10
2.6
10
100
0
52
61
0
19
19
1.35
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5.5
46
78
16
232
29
19
27
22
1.98
12341186--12341443
140
1.8
140
89
4
405
29
19
27
22
1.98
12341186--12341444
47
5.6
47
81
11
270
29
19
28
22
1.98
12342545--12342583
21
1.9
21
89
5
62
12
35
30
20
1.90
12348300--12348346
24
2.0
24
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40
4
2
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1.32
12363341--12363365
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
12364656--12364710
24
2.2
26
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69
10
10
9
69
1.38
12364668--12364723
24
2.3
25
78
6
60
17
8
7
66
1.42
12374037--12374088
20
2.6
20
78
0
59
40
40
15
3
1.65
12388381--12388423
10
4.3
10
85
11
61
65
2
6
25
1.30
12390375--12390442
3
22.7
3
82
11
77
73
0
1
25
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12390372--12390457
6
14.0
6
79
13
68
75
0
1
23
0.87
12397230--12397262
16
2.1
16
94
0
57
57
15
18
9
1.63
12398276--12398301
13
2.0
13
100
0
52
38
7
7
46
1.61
12399289--12399334
24
2.0
22
83
8
56
56
8
6
28
1.54
12400028--12400083
29
1.9
29
100
0
112
32
12
8
46
1.73
12406400--12406447
2
24.0
2
95
0
87
50
2
0
47
1.12
12407857--12407918
30
2.1
30
96
0
115
24
3
14
58
1.51
12424689--12424727
12
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12
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10
55
53
0
0
46
1.00
12428663--12428803
76
1.9
76
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1
176
31
19
19
29
1.96
12430444--12430522
41
1.9
42
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7
108
20
29
22
27
1.98
12430444--12430532
41
2.1
42
82
10
103
19
29
24
26
1.98
12431246--12431424
40
4.5
40
82
2
193
35
16
26
22
1.95
12431243--12431424
79
2.3
80
82
4
226
35
16
25
22
1.95
12433557--12433608
25
2.1
25
96
0
95
30
7
17
44
1.77
12443583--12443672
3
28.7
3
86
10
119
65
0
2
32
1.05
12443747--12443807
11
5.4
11
77
13
61
65
1
4
27
1.22
12443735--12443794
21
2.8
21
76
16
61
65
1
8
25
1.30
12444618--12444659
20
2.1
20
82
8
50
50
4
14
30
1.63
12445774--12445828
24
2.3
25
90
6
87
52
0
1
45
1.11
12446447--12446478
16
2.0
16
100
0
64
50
0
31
18
1.48
12446675--12446700
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
12446700--12446759
23
2.5
24
81
8
77
43
6
6
43
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12466832--12466876
23
2.0
22
83
12
56
46
2
13
37
1.55
12470153--12470253
41
2.4
43
80
11
118
28
26
18
25
1.98
12472742--12472783
22
1.9
22
85
0
57
42
11
9
35
1.74
12476536--12476614
27
2.8
27
88
5
95
55
2
5
36
1.35
12476562--12476618
27
2.1
27
100
0
114
57
3
3
35
1.33
12482839--12482889
20
2.6
21
81
12
63
56
0
1
41
1.10
12482843--12482923
18
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64
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16
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16
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0
64
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0
6
31
1.20
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2.0
57
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11
137
56
0
6
37
1.25
12483166--12483215
4
12.5
4
100
0
100
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0
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1.50
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10
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10
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1
58
1.23
12483590--12483641
19
2.8
18
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77
36
0
1
61
1.07
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14
2.9
14
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50
60
0
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30
1.28
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1.9
27
100
0
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19
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1.12
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33
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0
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0
0
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1.9
18
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0
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0
0
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1.9
28
85
11
74
37
22
11
28
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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19
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4
0
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0
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38
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1.77
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3.2
114
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9
444
37
23
5
33
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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9
0
74
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
0
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0.73
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0
0
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12679790--12679952
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20
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0
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9
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438