Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  53  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13570340--13570405
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1.9
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1.9
161
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0
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18
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1.93
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2.0
18
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5
54
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2
0
48
1.16
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1.9
23
85
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33
7
7
52
1.56
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18
2.2
18
100
0
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20
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1.70
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100
0
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2.0
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21
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20
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22
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0
0
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19
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2
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1.8
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94
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27
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22
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28
26
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1.99
13627810--13627885
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2.1
37
97
0
143
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21
17
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
50
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33
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11
7
40
1.70
13631031--13631105
33
2.4
29
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14
89
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10
6
42
1.66
13643346--13643404
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2.2
27
90
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10
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0
0
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2.0
20
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2.0
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18
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2.0
20
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17
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26
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1.94
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36
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0
0
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2.3
12
100
0
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233
20
21
29
27
1.98
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1.8
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96
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29
27
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3.0
30
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10
18
15
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3.9
46
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233
20
21
29
27
1.98
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93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
13695600--13695775
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232
20
21
29
28
1.98
13695596--13695767
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1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13698725--13698804
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5.4
15
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10
18
13
57
1.64
13698716--13698803
30
3.0
30
80
11
92
10
18
15
55
1.68
13701171--13701351
46
3.9
46
81
9
233
20
21
29
27
1.98
13701173--13701343
93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
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2.8
21
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10
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28
30
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1.94
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24
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0
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1.22
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12
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0
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20
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62
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28
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1.98
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93
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28
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1.95
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3
51
78
5
5
10
1.07
13731947--13732015
12
5.8
12
79
3
68
75
4
8
11
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13731947--13732003
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2.4
24
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2
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5
7
10
1.12
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46
75
12
203
28
21
29
20
1.98
13745186--13745356
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94
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30
17
1.96
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2.1
33
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0
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27
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19
0
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0.90
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25
25
23
25
2.00
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2.00
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2.00
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2.00
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202
25
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2.00
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202
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2.00
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23
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26
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2.1
19
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0
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5
7
7
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.74
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1.72
13855482--13855908
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1.75
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4
17
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13862885--13862918
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18
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1.54
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0
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0
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0
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40
12
6
40
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438