Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  384  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119668609--119668732
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2.8
45
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0
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18
20
17
43
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119671821--119671889
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2.8
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77
27
1
2
68
1.13
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2.4
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14
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1
0
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1.08
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0
2
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2.0
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2.1
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0
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119705623--119705713
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4.9
19
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119705623--119705736
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14
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119714448--119714742
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3.8
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2
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1.97
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3.4
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1.96
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4.0
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246
30
15
28
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1.96
119715152--119715316
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1.9
88
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0
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29
26
1.96
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23
2.8
23
80
14
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36
8
16
38
1.79
119715684--119715746
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82
11
76
36
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17
38
1.79
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0
0
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0.89
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2.7
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58
38
8
10
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1.70
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1.9
29
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25
19
21
33
1.97
119738578--119738707
45
2.9
45
88
2
183
23
21
29
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119741281--119741415
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2.2
60
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8
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25
23
20
30
1.99
119759607--119759667
5
12.4
5
89
3
97
37
0
21
40
1.53
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16
2.1
17
88
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52
55
5
8
29
1.54
119761527--119761676
68
2.2
68
90
0
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20
26
24
29
1.99
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45
4.9
45
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263
23
22
28
25
1.99
119770701--119770785
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2.0
43
90
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134
23
24
2
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18
2.2
18
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15
26
2
55
1.54
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2.0
30
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0
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26
2.2
26
100
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26
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26
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26
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22
15
24
1.92
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4.7
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25
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22
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2.00
119797285--119797466
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2.3
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226
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28
23
24
2.00
119801527--119801576
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1.9
26
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38
22
16
24
1.93
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0
141
41
0
19
38
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4.0
124
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518
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16
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1.88
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18
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18
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23
23
1.85
119811423--119811505
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2.7
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4
42
1.56
119814422--119814487
29
2.2
29
84
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80
31
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15
46
1.70
119814442--119814500
29
2.0
29
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3
82
30
5
13
50
1.63
119814620--119814714
31
3.1
30
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6
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0
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100
0
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0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119821683--119821733
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25
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5
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1.17
119834147--119834184
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3.9
10
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60
44
0
5
50
1.24
119834147--119834186
19
2.1
19
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0
71
42
0
5
52
1.23
119835162--119835577
120
3.5
120
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380
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14
21
31
1.94
119852028--119852123
51
1.9
48
81
10
113
14
35
28
21
1.93
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41
4.2
40
79
10
128
37
21
21
19
1.95
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1.97
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1.44
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7
7
50
1.61
119886991--119887158
27
6.2
27
90
3
223
33
22
25
18
1.96
119886991--119887160
54
3.1
54
90
1
252
34
22
24
18
1.96
119888778--119888887
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
34
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119889383--119889815
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2.0
215
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0
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17
17
35
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19
2.0
19
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0
10
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2.0
82
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0
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31
1.92
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2.0
247
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14
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1.89
119902312--119902400
17
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20
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72
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1.70
119902311--119902457
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37
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119904883--119904932
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0
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1.65
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0
250
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0
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21
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1.26
119925188--119925239
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1
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29
1.20
119925467--119925547
18
4.2
19
78
12
76
65
1
4
28
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119925462--119925544
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12
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1
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28
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25
2.0
25
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1.61
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0
6
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119925875--119925958
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1.97
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26
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1.98
119930568--119930871
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1.98
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19
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0
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0
0
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0
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1.9
157
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1.94
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0
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0
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17
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31
8
2
57
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
120003251--120003370
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21
24
17
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438