Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  67  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17486809--17486992
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17
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84
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5
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0
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0
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19
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2
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17536291--17536383
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55
1.24
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27
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24
15
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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17543250--17543283
2
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2
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0
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0
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27
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27
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31
25
14
28
1.95
17550331--17550484
29
5.5
28
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145
31
25
14
28
1.95
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48
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36
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25
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24
2.5
24
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26
3
8
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1.40
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20
2.0
20
100
0
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35
20
25
20
1.96
17565395--17565464
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22
24
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17567212--17567276
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2.0
32
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21
23
26
1.99
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43
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21
23
26
1.99
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2.5
392
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1389
28
21
23
26
1.99
17569432--17570402
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7.4
131
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1317
28
21
23
26
1.99
17570347--17570552
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204
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18
22
28
1.97
17570349--17570502
44
3.5
43
76
5
123
29
20
22
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17572002--17572143
51
2.8
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1.43
17572021--17572094
27
2.9
25
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32
5
2
59
1.34
17572113--17572175
24
2.5
24
72
10
56
30
6
4
58
1.43
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24
2.0
24
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0
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1
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1.14
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0
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24
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0
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14
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2.0
24
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0
71
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20
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14
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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0
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36
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19
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19
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4
0
38
1.18
17612589--17612711
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0
0
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0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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53
0
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40
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.80
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1.94
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0
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9
1
45
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438