Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  393  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122504379--122504427
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25
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0
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1.25
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0
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0
0
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109
66
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2
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1.15
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150
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3
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100
0
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0
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2.5
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29
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2.1
19
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4
53
17
15
0
66
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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14
30
1.94
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3.4
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0
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14
29
1.95
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2.8
48
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1.9
132
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22
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2.0
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28
8
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10
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2.2
25
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35
3
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1.34
122657234--122657281
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2.2
22
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3
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20
8
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1.71
122661595--122661647
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2.5
21
84
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19
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0
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64
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21
1.92
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3.2
25
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27
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37
17
22
22
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122677416--122677663
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2.7
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90
1
372
39
16
22
21
1.92
122677416--122677711
137
2.1
140
85
4
384
40
15
22
20
1.91
122677416--122677711
91
3.2
89
86
4
243
40
15
22
20
1.91
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196
2.0
196
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5
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1.76
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3.6
43
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17
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24
17
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32
1.96
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2.2
26
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1.74
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1.83
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11
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101
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1.76
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3
16
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1.65
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22
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0
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2
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5.6
25
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13
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3
6
35
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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102
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0
1
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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29
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0.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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142
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20
19
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438