Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  106  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30542880--30542938
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2.8
22
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1
1
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1.02
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18
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5
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22
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55
0
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40
1.20
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20
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1.98
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1.98
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1.9
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25
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2.0
43
100
0
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25
16
20
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30629911--30630063
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0
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25
28
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27
1.98
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28
2.4
28
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0
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1.94
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10
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68
18
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6
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1.75
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27
18
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1.98
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213
22
26
20
30
1.98
30682554--30682766
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2.3
93
84
4
277
22
26
20
30
1.98
30700827--30700955
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2.8
46
90
0
195
31
30
19
18
1.96
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2.2
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5
5
47
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1.97
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2.0
103
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320
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19
25
27
1.99
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2.3
43
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0
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20
27
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1.99
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2.2
30
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18
1.62
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21
2.0
21
95
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2
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1.56
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17
2.4
17
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4
53
48
0
10
41
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30718343--30718532
9
20.6
9
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107
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1
13
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1.52
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202
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1
12
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1.50
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2.0
90
86
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259
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2
11
47
1.53
30718319--30718532
114
1.9
114
84
5
290
38
1
13
47
1.51
30718379--30718563
87
2.1
87
84
7
234
38
2
11
47
1.53
30718637--30718692
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3.8
15
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0
1
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1.11
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357
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1.9
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2.0
183
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4
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26
6
35
1.81
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114
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66
98
0
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26
4
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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14
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42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
28
24
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438