Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
200
40
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415
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37
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4
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0
16
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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1.96
7048176--7048367
91
2.1
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21
2.0
20
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0
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1.40
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21
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34
1.47
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24
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68
62
3
3
30
1.28
7078268--7078418
20
6.7
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26
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0
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0
0
50
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16
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58
2
3
36
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.92
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183
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1
1286
21
28
13
36
1.92
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274
2.9
274
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1
1295
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28
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1.92
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2.0
31
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24
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66
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1.19
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20
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2
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11
14
31
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7122517--7122551
2
17.5
2
93
0
61
48
0
2
48
1.16
7122727--7122776
19
2.5
21
81
15
61
56
6
6
32
1.48
7122772--7122802
2
15.5
2
93
0
53
51
3
0
45
1.17
7122863--7122915
17
3.2
17
76
7
56
64
1
7
26
1.31
7124410--7124564
43
3.6
43
74
10
163
17
21
21
40
1.92
7124676--7124828
44
3.5
43
69
15
125
19
23
21
35
1.96
7124404--7124838
87
5.0
87
85
4
558
19
22
20
37
1.95
7127087--7127265
27
6.7
27
89
1
254
41
20
7
30
1.79
7127087--7127319
81
2.9
80
82
5
272
40
21
8
30
1.82
7127288--7127660
27
13.9
27
84
2
304
28
24
8
38
1.84
7127082--7127778
27
25.8
27
81
5
162
34
21
8
35
1.84
7127315--7127661
81
4.3
82
87
5
449
28
23
8
39
1.84
7127315--7127676
54
6.7
54
85
3
442
28
24
8
39
1.83
7127540--7127706
81
2.1
81
82
0
199
32
22
8
36
1.84
7127731--7127786
27
2.1
26
83
9
69
37
10
12
39
1.78
7127840--7127904
27
2.4
27
82
5
78
35
18
24
21
1.96
7129063--7129110
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
7129154--7129212
20
3.0
20
92
0
100
35
11
20
32
1.89
7129263--7129429
24
7.0
24
93
3
257
28
22
22
26
1.99
7129263--7129430
71
2.3
71
90
4
257
29
22
22
26
1.99
7129621--7129715
31
3.1
31
96
0
172
40
15
21
23
1.91
7137522--7137564
22
2.0
22
81
9
52
13
25
6
53
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7141306--7141330
2
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2
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0
50
52
0
0
48
1.00
7141385--7141455
26
2.7
26
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4
70
60
4
4
30
1.35
7141507--7141558
20
2.6
19
84
9
59
57
5
3
32
1.40
7141440--7141577
51
2.5
55
76
14
142
56
4
4
34
1.39
7141528--7141570
21
2.0
21
86
9
59
58
6
2
32
1.38
7143221--7143261
2
20.5
2
100
0
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48
0
0
51
1.00
7145053--7145115
25
2.6
25
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7
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0
3
30
1.07
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2.1
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40
0
1
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2.3
23
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1
1.20
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2.4
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25
16
23
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47
2.4
47
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154
25
16
23
35
1.95
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2
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0
50
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0
0
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1.39
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19
2.7
19
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14
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1
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0
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0
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0
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7186360--7186566
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2.5
85
78
12
209
62
1
2
33
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7186412--7186570
68
2.3
67
81
10
164
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1
1
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1.12
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13
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0
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0
0
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0
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11
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2.0
42
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0
155
23
25
18
32
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438