Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  386  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120428219--120428300
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3.2
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0
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0
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1.05
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2.7
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6
69
17
10
0
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1.12
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3.3
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9
52
16
11
0
72
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2.4
19
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58
19
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15
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2.0
64
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20
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1.97
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22
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22
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2.0
23
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0
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33
0
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1.23
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2.0
21
100
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9
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24
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90
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5
4
30
1.41
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4.9
47
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153
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19
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22
21
28
1.99
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259
1.8
262
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2
849
25
23
22
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1.99
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4.9
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153
28
23
19
28
1.98
120465428--120465678
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5.7
43
70
15
156
25
24
20
28
1.99
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1.9
133
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2
410
25
23
22
28
1.99
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0
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1
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19
32
23
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16
2.0
18
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54
17
17
17
47
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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2
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1.84
120495535--120495607
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2.2
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27
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1.83
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32
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3.7
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210
30
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19
21
1.98
120501037--120501111
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2.0
37
94
0
132
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1.89
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2.0
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2.0
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2.0
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4
0
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120537527--120537572
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2.0
23
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2.0
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51
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
120540465--120540490
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1.19
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1.23
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50
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2.4
42
81
6
107
28
22
19
29
1.98
120583115--120583252
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3.2
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10
122
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24
20
28
1.99
120589600--120590001
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8.7
46
86
0
518
20
23
13
42
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
22
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0
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20
1.84
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12
100
0
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40
1.91
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2.1
53
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3
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16
17
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1.89
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1.74
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96
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0
257
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10
1.82
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109
25
16
26
30
1.97
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1.92
120614031--120614193
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1.92
120629150--120629196
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1.9
24
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2
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1.64
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0
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0
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0
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2.0
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120644347--120644394
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2.9
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2.3
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80
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143
29
15
30
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
1.95
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1.93
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1.54
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2
149
35
13
22
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120689744--120689877
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1.93
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44
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2
149
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13
22
27
1.92
120695698--120695831
46
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1.93
120712204--120712262
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0
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27
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0
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40
24
6
29
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438