Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  350  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109138472--109138758
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3.6
80
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2
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25
22
25
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109141523--109141550
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0
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0
0
50
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68
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4
174
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18
13
26
1.87
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29
4.7
30
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13
135
29
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18
21
1.97
109145354--109145521
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2.9
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1
291
29
30
18
22
1.97
109145690--109145806
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2.7
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0
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34
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2.9
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24
15
29
29
1.96
109153053--109153267
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25
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16
27
29
1.97
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2.6
43
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2
129
32
13
20
33
1.91
109160343--109160622
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2.0
139
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0
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25
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2.1
15
100
0
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29
0
19
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42
2.5
42
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0
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29
14
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22
1.93
109165420--109165516
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3.5
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28
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31
1.94
109165441--109165516
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2.8
26
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89
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1.94
109173406--109173511
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2.5
42
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0
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22
1.93
109173520--109173589
27
2.6
27
81
2
77
30
14
22
32
1.94
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3.7
23
93
0
141
15
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20
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2.1
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0
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21
31
28
18
1.96
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2.0
37
100
0
150
21
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8
41
1.81
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40
4.6
40
89
3
267
23
21
30
25
1.99
109209589--109209768
79
2.3
79
90
2
272
23
21
30
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109217557--109217735
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4.6
40
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4
240
24
19
30
26
1.98
109223653--109223952
138
2.2
138
79
7
315
26
29
17
27
1.97
109223645--109223954
46
6.7
47
71
13
144
25
30
18
26
1.98
109230721--109230816
40
2.4
40
86
5
124
26
21
28
23
1.99
109232197--109232237
17
2.4
17
88
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36
0
19
43
1.51
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2.2
24
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16
43
7
32
1.76
109237373--109237397
10
2.5
10
100
0
50
28
20
12
40
1.87
109241561--109241782
46
4.8
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11
151
23
29
19
27
1.98
109242285--109242353
33
2.1
33
100
0
138
24
18
17
39
1.92
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24
3.6
24
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0
156
32
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19
21
1.97
109247210--109247244
18
1.9
18
94
0
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20
20
14
45
1.85
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5.6
40
92
2
340
21
27
23
26
1.99
109259189--109259408
40
5.6
40
88
2
304
23
26
22
26
2.00
109260000--109260033
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
109262315--109262448
46
2.9
45
80
8
155
32
18
26
22
1.97
109262500--109262620
49
2.5
49
87
2
172
28
20
28
22
1.99
109273495--109273611
43
2.8
41
76
7
110
24
22
24
28
1.99
109279760--109279887
46
2.8
46
84
2
159
28
18
31
21
1.97
109279856--109280023
93
1.8
92
84
6
232
25
19
29
25
1.98
109279857--109280124
49
5.6
49
74
9
189
26
19
28
25
1.99
109283592--109283629
18
2.1
19
90
5
60
34
0
2
63
1.09
109283704--109283813
50
2.2
50
95
0
193
33
16
12
37
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109283717--109283817
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50
100
0
202
31
15
13
38
1.87
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3.5
28
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14
25
29
1.95
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29
2.7
28
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13
75
30
14
26
28
1.95
109294836--109294999
71
2.3
71
97
0
310
34
18
28
18
1.95
109297051--109297151
28
3.5
28
80
11
107
29
14
25
29
1.95
109297080--109297155
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
109311357--109311419
24
2.6
24
92
0
99
22
19
26
31
1.97
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2.6
24
94
0
108
20
17
26
34
1.95
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2.1
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2
23
36
1.70
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3.2
25
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17
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29
4
30
34
1.78
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2.0
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100
0
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29
32
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60
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1.11
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0
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0
0.96
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17
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17
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Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
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1.81
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Period
Size
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Number
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1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438