Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  232  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71675667--71675856
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2.4
80
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18.3
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21
26
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1.86
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6
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1.80
71678353--71678508
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5.4
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207
48
12
16
21
1.80
71678353--71678533
30
6.7
24
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22
137
47
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17
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1.81
71678353--71678510
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1.9
84
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2.7
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0
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1.98
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19
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1.97
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5.5
29
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180
26
16
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1.97
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40
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1.99
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25
1.99
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27
3.7
26
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28
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214
26
25
25
22
2.00
71727132--71727285
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3.8
41
82
6
145
27
25
25
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71732120--71732312
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4.8
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5
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24
26
22
2.00
71732120--71732338
80
2.7
80
80
6
230
26
24
26
22
2.00
71737157--71737350
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4.8
40
78
5
185
26
24
26
23
2.00
71737157--71737335
80
2.2
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4
229
25
24
26
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2.00
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40
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24
1.94
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1.94
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1.96
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29
1.96
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28
3.5
28
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4
108
29
16
24
29
1.96
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1.94
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43
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14
26
1.95
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32
2.2
29
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19
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32
4
10
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1.57
71766012--71766070
19
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19
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71766008--71766071
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2.0
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100
0
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0
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1.9
18
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0
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51
11
5
31
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71780240--71780381
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1.83
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4.7
45
84
6
243
23
20
29
26
1.99
71781184--71781403
90
2.5
89
87
5
295
24
20
29
26
1.99
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4.2
40
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5
153
26
26
22
25
2.00
71791150--71791385
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5.0
47
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350
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13
13
43
1.82
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45
2.6
45
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220
21
21
28
28
1.99
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101
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1.98
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20
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1.75
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22
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0
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0
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Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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T
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(0-2)
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25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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(0-2)
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26
19
26
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438