Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  429  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.5
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0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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19
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2
34
1.28
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2.0
23
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2
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0
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29
1.13
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33
1.55
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20
65
56
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4
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1.34
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4.4
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1.44
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3.8
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2
149
22
4
44
28
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.71
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30
3.4
30
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166
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48
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1.67
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0
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18
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1.90
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25
2.0
25
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8
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53
4
14
27
1.60
132444949--132445103
38
4.1
38
94
0
256
16
21
25
37
1.93
132444949--132445138
38
4.9
38
89
2
193
15
21
26
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
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12
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0
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0
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2.0
87
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0
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0
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20
20
29
29
1.98
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0
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20
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0
0
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1.9
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29
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2.0
57
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0
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50
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2.1
28
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3
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3
7
47
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.4
29
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4
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47
1
0
51
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.84
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1
325
21
21
28
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438