Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  392  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122190302--122190445
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13
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122190303--122190444
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13
203
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1.9
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0
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29
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20
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20
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19
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2.3
84
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1
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20
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122214761--122214964
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19
15
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1.86
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1.9
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51
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0
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2.0
53
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1
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1.96
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1.9
13
100
0
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20
1.98
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216
28
29
21
20
1.98
122235119--122235290
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
122235112--122235287
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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28
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17
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1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
122239857--122239964
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2.7
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21
29
25
23
1.99
122247391--122247419
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2.0
15
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62
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13
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9.3
11
69
22
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35
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58
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24
1.39
122248217--122248306
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2.3
40
80
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107
63
3
8
24
1.39
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19
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20
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1.62
122249359--122249410
23
2.2
24
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7
7
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122249606--122249644
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0
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20
22
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10
18
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1.84
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31
9
18
39
1.84
122251087--122251193
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1.9
56
88
3
164
31
10
18
39
1.84
122251150--122251211
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2.2
28
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1.81
122258002--122258130
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3.0
43
79
4
143
31
26
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122261182--122261214
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2.2
15
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2.3
20
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58
28
0
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1.10
122261911--122261979
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2.1
33
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104
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11
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1.40
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2.0
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100
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56
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14
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1.92
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25
1.97
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17
35
1.94
122333216--122333413
71
2.8
70
91
3
258
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28
17
33
1.95
122336470--122336688
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4.7
45
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19
28
24
1.99
122338452--122338484
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.0
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1
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0
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1.81
122431906--122432199
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2.0
146
96
0
543
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26
6
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
20
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0
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0
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19
10
26
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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154
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10
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0
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0
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21
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43
0
0
55
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438