Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   

This is table  435  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134075428--134075465
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
134075622--134075657
19
1.9
18
88
5
54
38
0
2
58
1.13
134076532--134076570
20
2.0
20
85
9
55
30
7
0
61
1.24
134078629--134078679
3
16.7
3
95
4
93
33
0
0
66
0.92
134081005--134081049
18
2.5
19
78
10
58
33
13
17
35
1.89
134081982--134082039
30
2.0
29
83
10
73
65
1
1
31
1.13
134088095--134088281
93
2.0
93
97
0
356
24
16
23
36
1.94
134092384--134092424
16
2.5
17
96
4
75
36
21
24
17
1.94
134100333--134100374
21
2.0
21
100
0
84
52
19
0
28
1.46
134107111--134107137
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
134119189--134119228
21
1.9
21
89
0
62
55
5
0
40
1.22
134120684--134120739
30
1.9
30
88
3
87
37
5
10
46
1.62
134121943--134122061
59
2.0
59
100
0
238
16
16
11
54
1.70
134125404--134125430
12
2.2
12
100
0
54
22
14
7
55
1.64
134132524--134132573
2
25.0
2
95
0
91
50
2
0
48
1.12
134136019--134136094
29
2.5
31
77
16
88
51
3
5
39
1.43
134136971--134137018
20
2.3
20
86
10
62
50
4
0
45
1.21
134137776--134137849
30
2.5
29
84
8
96
47
1
5
45
1.34
134137911--134137972
31
2.0
31
84
6
81
54
0
4
40
1.22
134140523--134140554
8
4.0
8
100
0
64
75
0
0
25
0.81
134141139--134141179
3
13.7
3
84
0
55
7
29
0
63
1.21
134141948--134142000
22
2.4
22
83
0
70
13
3
13
69
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134145688--134145739
25
2.1
25
100
0
104
53
15
15
15
1.73
134146850--134146895
24
1.9
24
95
0
83
43
2
10
43
1.51
134149947--134149992
24
1.9
24
100
0
92
32
28
4
34
1.77
134152996--134153043
19
2.8
17
81
12
62
75
2
10
12
1.14
134156576--134156629
21
2.5
22
72
9
56
59
3
5
31
1.38
134157404--134157434
6
5.2
6
100
0
62
0
51
32
16
1.44
134160453--134160486
2
17.0
2
93
0
59
2
0
47
50
1.16
134165772--134165806
18
1.9
18
88
0
52
5
48
11
34
1.63
134175544--134175600
22
2.5
23
80
5
62
14
1
10
73
1.17
134178777--134178814
20
2.0
20
89
5
60
50
2
0
47
1.15
134184115--134184633
257
2.0
257
93
0
885
33
13
15
37
1.87
134198902--134198938
1
37.0
1
100
0
74
100
0
0
0
0.00
134202472--134202829
179
2.0
179
99
0
707
34
11
10
43
1.75
134204490--134204536
22
2.0
24
84
8
62
38
2
6
53
1.39
134206676--134206755
40
2.0
40
100
0
160
47
17
2
32
1.61
134219168--134219221
19
2.8
19
72
13
56
57
0
3
38
1.17
134224971--134225027
30
1.9
30
85
0
78
33
3
19
43
1.68
134229564--134229609
24
1.9
24
100
0
92
50
10
17
21
1.77
134230754--134230800
24
2.0
23
84
12
60
36
4
0
59
1.17
134241586--134241620
17
2.0
18
88
5
54
60
0
8
31
1.27
134243398--134243425
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
134245403--134245455
3
17.3
3
96
3
97
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134253359--134253384
7
3.7
7
100
0
52
30
38
30
0
1.58
134255237--134255301
28
2.2
30
81
5
80
43
9
7
40
1.65
134263970--134264079
31
3.5
31
77
8
114
43
12
7
36
1.71
134264665--134264716
3
17.3
3
100
0
104
67
0
0
32
0.91
134273657--134273797
53
2.7
53
89
2
203
26
17
27
29
1.97
134279666--134279749
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
134287559--134287654
48
2.0
48
100
0
192
29
31
16
22
1.96
134297230--134297277
19
2.6
19
86
3
71
35
2
14
47
1.56
134297294--134297382
42
2.1
42
91
0
142
28
5
15
50
1.67
134298934--134298968
18
1.9
18
88
0
52
28
5
42
22
1.76
134305056--134305087
2
16.0
2
93
0
55
46
0
0
53
1.00
134315477--134315527
14
3.6
14
73
5
57
62
1
7
27
1.33
134315476--134315533
29
2.0
29
100
0
116
62
3
6
27
1.37
134321341--134321367
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
134323031--134323071
20
2.0
20
100
0
82
34
29
21
14
1.93
134326488--134326538
14
3.6
14
73
5
57
62
1
7
27
1.33
134326487--134326544
29
2.0
29
100
0
116
62
3
6
27
1.37
134332350--134332376
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
134334040--134334080
20
2.0
20
100
0
82
34
29
21
14
1.93
134339894--134339933
19
2.2
18
90
4
62
45
12
2
40
1.56
134342181--134342250
18
4.0
18
88
3
99
25
21
18
34
1.96
134347607--134347642
18
2.0
18
100
0
72
27
27
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134347815--134347850
18
2.0
18
100
0
72
16
22
22
38
1.93
134353178--134353390
46
4.6
46
86
3
277
43
12
23
21
1.86
134353188--134353390
92
2.2
92
90
1
309
43
12
23
20
1.86
134353188--134353427
46
5.2
46
81
7
247
42
13
23
20
1.88
134353686--134353718
17
2.0
17
94
5
59
48
0
15
36
1.45
134356054--134356139
42
2.0
42
100
0
172
26
24
18
30
1.98
134359078--134359166
18
4.9
18
85
0
115
31
23
14
30
1.94
134359076--134359166
36
2.5
36
89
0
137
30
23
15
30
1.95
134366414--134366452
18
2.1
18
85
4
51
38
2
0
58
1.12
134369085--134369122
16
2.4
17
86
8
53
34
2
0
63
1.09
134377525--134377568
20
2.2
20
87
0
61
63
2
0
34
1.07
134377533--134377587
19
2.8
19
80
2
56
61
1
1
34
1.17
134380660--134380687
13
2.2
13
100
0
56
21
35
14
28
1.92
134385406--134385472
22
3.2
22
61
26
54
41
8
20
28
1.83
134385405--134385486
41
2.0
41
100
0
164
39
9
21
29
1.86
134390426--134390480
19
2.8
20
77
5
67
40
1
0
58
1.09
134390364--134390462
46
2.2
43
81
13
112
47
4
1
47
1.27
134391461--134391522
31
2.0
32
84
9
83
43
12
6
37
1.69
134397242--134397274
16
2.1
16
100
0
66
6
18
6
69
1.30
134417014--134417072
27
2.2
27
100
0
118
18
22
22
37
1.94
134427376--134427469
29
3.3
30
68
26
69
38
5
0
56
1.22
134431529--134431579
16
3.2
16
85
0
57
58
5
3
31
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134438017--134438084
22
3.0
22
81
10
84
41
19
23
16
1.90
134439263--134439350
7
12.0
7
69
29
51
53
1
1
44
1.15
134439260--134439310
15
3.3
16
83
10
70
52
0
0
47
1.00
134439260--134439315
20
2.8
20
83
8
60
53
0
0
46
1.00
134439260--134439292
5
6.4
5
96
3
57
57
0
0
42
0.98
134440282--134440476
103
1.9
102
84
7
261
41
9
6
42
1.63
134442225--134442274
25
1.9
27
84
15
70
60
2
0
38
1.09
134455926--134455958
16
2.1
16
100
0
66
42
15
6
36
1.71
134457964--134458000
19
1.9
19
89
10
58
35
0
10
54
1.36
134458118--134458155
19
1.9
19
89
5
58
28
21
10
39
1.86
134459090--134459136
15
3.0
15
75
22
51
38
6
0
55
1.26
134459365--134459392
12
2.3
12
100
0
56
21
7
14
57
1.61
134464374--134464435
29
2.1
30
81
6
72
45
8
3
43
1.49
134470139--134470200
23
2.7
23
84
2
70
54
22
4
17
1.61
134470196--134470246
24
2.1
24
89
7
77
72
13
0
13
1.12
134472687--134472878
103
1.9
103
95
0
348
41
8
7
42
1.64
134483389--134483414
7
3.7
7
100
0
52
53
0
0
46
1.00
134483497--134483530
16
2.1
16
88
0
50
70
2
0
26
1.01
134488466--134488507
18
2.2
20
87
8
61
59
4
0
35
1.19
134488460--134488508
19
2.4
21
77
16
59
57
6
0
36
1.24
134491074--134491268
98
2.0
98
85
2
266
26
8
23
42
1.82
134491173--134491813
186
3.4
185
89
0
933
25
14
20
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
134491734--134491911
98
1.8
98
81
7
227
28
9
16
45
1.78
134491734--134491933
98
2.0
98
80
5
217
27
11
17
44
1.82
134492315--134492363
23
2.1
23
100
0
98
22
38
8
30
1.83
134496375--134496436
31
2.0
31
90
0
97
43
12
11
32
1.79
134497366--134497411
24
2.0
23
82
4
56
36
6
0
56
1.25
134501163--134501274
56
2.0
56
100
0
224
26
23
5
44
1.74
134506796--134506873
31
2.5
30
81
4
84
21
8
19
50
1.75
134510671--134510699
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
134515464--134515502
21
2.0
21
90
10
64
30
0
5
64
1.15
134516181--134516221
19
2.1
19
86
13
57
73
2
4
19
1.13

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438