Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
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2
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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21
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22
21
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1
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8914784--8914847
19
3.3
18
75
14
56
28
1
4
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1.21
8914784--8914864
40
2.0
40
81
9
94
32
2
3
61
1.26
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24
2.2
27
87
9
82
57
0
7
35
1.26
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19
2.3
19
88
8
61
37
4
4
53
1.43
8931913--8931985
32
2.3
31
79
6
76
27
2
9
60
1.42
8933917--8933965
14
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13
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2
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1.04
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15
2.6
15
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1.27
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12
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26
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23
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23
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1.04
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0
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0
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3.8
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3
52
31
2
0
65
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8978897--8978929
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17
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0
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27
0
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1.03
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2.2
21
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0
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8978997--8979037
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2
0
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1.10
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15
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2
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27
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29
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18
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31
3
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16
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0
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19
2.9
19
78
0
58
19
28
26
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9010316--9010377
31
2.0
31
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9
11
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1.73
9012575--9012605
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0
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0
0
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37
0
2
60
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438